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PDB数据库中查找蛋白质结构数据.docx

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  • 卖家[上传人]:枫**
  • 文档编号:464306483
  • 上传时间:2022-09-27
  • 文档格式:DOCX
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    • PDB数据库中查找蛋白质结构数据1.查找蛋白质结构,在检索框输入关键字或名称观看三维数据结构SummnrySeqruenceIi^jinotatiDnsJSeq_Simdlanty3DSimilart^"UteratureIBiol.&Chem.*Methc-dsTGeamBtrY11LinksCrystalstructureofhumancytoglobinat1.68angstromsresolution2DC3HDi^plrty拜Im*•DownlondFik*^TDSbw?n>IhreP«ge审Dol:lo.^Jlu/pdbJdc3/pdbPrlnidryGldllonHighresolutionstructureofhuimancvtoalcpbin:identificationofextraN-andCtemninizmdanewdlmeirizaliaiimcKlie-M^kinA,H.j.H..;H丄:*N.IL;环itqJ*』Mrnol:C2QM)AdiCn'ftillogr.^vctJD62^671-^77PubMedsl>dohin.na7/soiW744J.^MnnoilScorchRelntedAjrtki«inPubMedPiiftkNrdAbyrrtdlzC>tookJbwi(CgbJis«『真电忒lydiscoveredrnenibeferfkha^ertebr^ehswi-centfiningglobinMmilpThpsrnjclhjrpnFanrwrrv^tslfarmofwildtYpghuin.anCgb(tpacf霄noupC2]wasdereiriinnedacairE&alunkmar3_6SAngakroirLThereauits前口曲[Mepr»ence.„[ReddMure些StidrdhPubMed皿UmcJE占J4.选择3Dview,可视化蛋白三维结构视图呈现。

      且数据量较大,需要较长的时间才能在窗口显示由于是远程计算机服务器进行图型构建,Jbl5.蛋白结构显示的参数设定:SlTiictijri?D科刮阻OSVniFifltFVT中軒SvmmiStfvStoichiometrYStlec:Oi-irtlabjhSjjmmilryCustonC2曲召5*P-l€CT□和1刖MotkOSLrinr自定义设定脚本选项:UyMrip怖n°OptionsUomnlnAs$k)inmMirDPOMann1LOCridonchfsiriotkMiMtOlrtJk2DC3Aa2DC3AJ0A:42DC3BC32DC3B00-POPOjaa2DC3AaA:17-L?a初IXZJHd2bC3B^Legend:Acliirktcvi^winJnwlDciEikdiiih、下载三维数据文件1.在查询结果窗口的右边找到以下图型2DC3時DisplayFiles'1DownloadFiles□5tiareihisPage如图:选择DownloadFiles2•确定下载的文件类型,一般根据你要使用蛋白质结构数据而定closeFASTASaqu^rKQputHlc;lcO:UhI-le:DZmmClFFilefeci:nle;oejJiDBpri/XMLHlePDBMLAMLHie(az)btrjaure卜actor(lextjtrutnjre卜actor(o?}选择PDBFile(Text).BiologicalAsantibly3.用写字板打开PDB文件,可以看到蛋白质数据库文件实质也是文本文件。

      JEQIHCCITEII尿詁偉・miSFOfT21-DBC-®2K3TITL1休苗USTWCTTM轉时占・CmUOEElJiTLfifl晒:亦房TTn.12EE£CLCTT£lE■XHPE?HOL^ID:1」OMF»2KLB^LE;C7MKUIKI.CUIFKj3.CBiXMLA.Ba0:fPK-4S11i:«ll.口97如LOMIhHCILSTILLA7B^LLiCTIllTiai-COIF1CS(LS5DC1JT1TFH7TEIIepi?mKVf^RklD'l1.snnrazareAjiiai-ErinmFir:tonsirzcismm$ij科肆阁iaw;rviyi.财麻IFiDM金欝・it卜悴z»ca1OSSi4.下载Pymol,并安装。

      点DOWNLOAD进入下载,选择windows版本,并安装(需要paymoney)Supp^irtPyMOLAilliAftSjiJr「灿二11£出二0丫I'.'lifll*i*■Ilr>—'--!*=i-tfri-.v.:和SrhrofTifigwDOWNLOADPyHOtniMdrBXONews』4附"aiiDUF-l.lOL.^HrjL^rd..f.lCH-yl7jjl.h底勲如:u*■内R^h-rt-或到此网站下载:选择win32,1.7.1.1版本并安装,需要python编程软件的支持,可从360软件管件直接安装安装如图:pymoh1.7.1.1使用详情参见教程,注意打开程序需要找到python的安装目录:C:\Python27\PyMOL,找到文件,双击启动程序打开或使用RasMol软件进行三维视图分析,步骤同上。

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