伯杰氏细菌系统分类学手册伯杰氏细菌系统分类学手册伯杰氏细菌.doc

伯杰氏细菌系统分类学手册伯杰氏细菌系统分类学手册《伯杰氏细菌系统分类学手册》（“Bergry ’s Manual of Systematic Bacteriology），第”二版，2001年春，Springer-Verlag公司，Gerge M. Garrity, Mattew Winters和Nenise B. Searles第二版五卷本与第一版相比又有较大改动，与第八、第九版伯杰氏细菌鉴定学手册也有明显区别它不是根据表型，而是以系统发生（进化）的框架为基础参照了16S rDNA的序列编辑们预计在手册第一卷到最后一卷出版的 5、6 年间，可能会再发现 100 多个新属 他们会不断修订错误， 在后继出版的各卷中，出一个新的分类大纲伯杰氏手册公司的网站（ ）也会定期更新第二版的第一卷在 2001 年 5 月出版；第二卷在 2004 年 2 月出版古生菌域 （ Domain “Archaea）”1. 第 AI 门 泉古生菌门 (Crenarchaeota phy. nov).第 I 纲 热变形菌纲 (Thermoprotei class. nov).第 I 目 热变形菌目 (Thermoproteales)第 I 科 热变形菌科 (Thermoproteaceae)第 I 属 热变形菌属 ( Thermoproteus) 第 II 属 热杆菌属 (Caldivirga )第 III 属 热棒菌属 (Pyrobaculum ) 第 IV 属 热枝菌属 ( Thermocladium) 第 II 科 热丝菌科 (Thermofilaceae) 第 I 属 热丝菌属 (Thermofilum )第 II 目 硫还原古球菌目 (Desulfurococcales ord. nov. ) 第 I 科 硫还原古球菌科 ( Desulfurococcaceae)第 I 属 硫还原古球菌属 ( Desulfurococcus) 第 II 属 (Acidolobus)第 III 属 气热菌属 (Aeropyrum )第 IV 属 浆果状火球菌属 (Ignicoccus ) 第 V 属 葡萄嗜热菌属 (Staphylothermus) 第 VI 属 斯梯特氏菌属 ( Stetteria)第 VII 属 恐硫球菌属 (Sulfophobococcus)第 VIII 属 热盘菌属 (Thermodiscus gen. nov.) 第 IX 属 耐热球菌属 (Thermosphaera)第 II 科 热网菌科 (Pyrodictiaceae ) 第 I 属 热网菌属 (Pyrodictium )第 II 属 栖高温菌属 (Hyperthermus) 第 III 属 热叶菌属 (Pyrolobus )第 III 目 硫化叶菌目 ( Sulfolobales) 第 I 科 硫化叶菌科 ( Sulfolobaceae) 第 I 属 硫化叶菌属 ( Sulfolobus)第 II 属 酸菌属 (Acidianus )第 III 属 生金球菌属 ( Metallosphaera )第 IV 属 栖冥河菌属 (Stygiolobus)第 V 属 硫代谢球菌属 (Sulfurisphaera ) 第 VI 属 硫化球菌属 (Sulfurococcus)2.第 AII 门 广古生菌门 (Euryarchaeota phy. nov).第 I 纲 甲烷杆菌纲 ( Methanobacteria class. nov. ) 第 I 目 甲烷杆菌目 ( Methanobacteriales )第 I 科 甲烷杆菌科 ( Methanobacteriaceae) 第 I 属 甲烷杆菌属 ( Methanobacterium)第 II 属 甲烷短杆菌属 (Methanobrevibacter ) 第 III 属 甲烷球形菌属 (Methanosphaera)第 IV 属 甲烷嗜热杆菌属 (Methanothermobacter ) 第 II 科 甲烷嗜热菌科 (Methanothermaceae)第 I 属 甲烷嗜热菌属 (Methanothermus)第 II 纲 甲烷球菌纲 (Methanococci class. nov. ) 第 I 目 甲烷球菌目 ( Methanococcales)第 I 科 甲烷球菌科 ( Methanococcaceae) 第 I 属 甲烷球菌属 ( Methanococcus)第 II 属 甲烷嗜热球菌属 (Methanothermococcus gen. nov.) 第 II 科 甲烷热球菌科 (Methanocaldococcaceae fam. nov.) 第 I 属 甲烷热球菌属 (Methanocaldococcus gen. nov.)第 II 属 甲烷干热菌属 (Methanotorris gen. nov.) 第 II 目 甲烷微菌目 (Methanomicrobiales )第 I 科 甲烷微菌科 ( Methanomicrobiaceae ) 第 I 属 甲烷微菌属 ( Methanomicrobium ) 第 II 属 甲烷袋状菌属 (Methanoculleus) 第 III 属 产甲烷袋菌属 (Methanofollis )第 IV 属 产甲烷菌属 (Methanogenium) 第 V 属 叶形甲烷菌属 (Methanolacinia ) 第 VI 属 甲烷盘菌属 (Methanoplanus)第 II 科 甲烷粒菌科 (Methanocorpusculaceae) 第 I 属 甲烷粒菌属 ( Methanocorpusculum)第 III 科 甲烷螺菌科 ( Methanospirillaceae fam. nov. ) 第 I 属 甲烷螺菌属 ( Methanospirillum )未定属第 I 属 产甲烷石状菌属 ( Methanocalculus )第 III 目 甲烷八叠球菌目 (Methanosarcinales ) 第 I 科 甲烷八叠球菌科 ( Methanosarcinaceae) 第 I 属 甲烷八叠球菌属 ( Methanosarcina)第 II 属 甲烷拟球菌属 (Methanococcoides) 第 III 属 甲烷喜盐菌属 (Methanohalobium ) 第 IV 属 甲烷嗜盐菌属 ( Methanohalophilus ) 第 V 属 甲烷叶菌属 (Methanolobus)第 VI 属 甲烷微球菌属 ( Methanomicrococcus) 第 VII 属 甲烷盐菌属 (Methanosalsum gen.nov.)第 II 科 鬃毛甲烷菌科 (Methanosaetaceae fam.nov.) 第 I 属 鬃毛甲烷菌科属 ( Methanosaeta)第 III 纲 盐杆菌纲 (Halobacteria class. nov. ) 第 I 目 盐杆菌目 (Halobacteriales )第 I 科 盐杆菌科 (Halobacteriaceae ) 第 I 属 盐杆菌属 (Halobacterium ) 第 II 属 盐盒菌属 (Haloarcula )第 III 属 盐棒杆菌属 ( Halobaculum ) 第 IV 属 盐球菌属 ( Halococcus)第 V 属 富盐菌属 (Haloferax )第 VI 属 盐几何形菌属 ( Halogeometricum ) 第 VII 属 盐杆状菌属 (Halorhabdus )第 VIII 属 盐红菌属 (Halorubrum ) 第 IX 属 盐栖菌属 ( Haloterrigena ) 第 X 属 无色嗜盐菌属 (Natrialba ) 第 XI 属 钠线菌属 ( Natrinema )第 XII 属 嗜盐碱杆菌属（ Natronobacterium ）第 XIII 属 嗜盐碱球菌属 (Natronococcus)第 XIV 属 嗜盐碱单胞菌属 (Natronomonas) 第 XV 属 碱红菌属 (Natronorubrum )第 IV 纲 热原体纲 ( Thermoplasmata class. nov.) 第 I 目 热原体目 (Thermoplasmatales ord. nov. ) 第 I 科 热原体科 (Thermoplasmataceae fam. nov.) 第 I 属 热原体属 (Thermoplasma)第 II 科 嗜酸古菌科 (Picrophilaceae ) 第 I 属 嗜酸古菌属 ( Picrophilus )第 III 科 铁原体科 (Ferroplasmataceae ) 第 I 属 铁原体属 (Ferroplasma )第 V 纲 热球菌纲 (Thermococci class. nov. ) 第 I 目 热球菌目 (Thermococcales)第 I 科 热球菌科 (Thermococcaceae) 第 I 属 嗜热球菌属 ( Thermococcus) 第 II 属古老球菌属 (Palaeococcus)第 III 属 热球菌属 (Pyrococcus)第 VI 纲 古生球菌纲 (Archaeoglobi class. nov. ) 第 I 目 古生球菌目 ( Archaeoglobales ord. nov. ) 第 I 科 古生球菌科 ( Archaeoglobaceae fam. nov.) 第 I 属 古生球菌属 ( Archaeoglobus)第 II 属 铁球菌属 (Ferroglobus )第 VII 纲 甲烷嗜高热菌纲 ( Methanopyri class. nov. ) 第 I 目 甲烷嗜高热菌目 ( Methanopyrales ord. nov. ) 第 I 科 甲烷嗜高热菌科 ( Methanopyraceae fam. nov.) 第 I 属 甲烷嗜高热菌属 ( Methanopyrus)3.细菌域 “ Bacteria第”BI 门 产液菌门 (Aquificae phy. nov.)第 I 纲 产液菌纲 (Aquificae class. nov. ) 第 I 目 产液菌目 (Aquificales ord. nov. ) 第 I 科 产液菌科 (Aquificaceae fam. nov. ) 第 I 属 产液菌属 (Aquifex)第 II 属 热杆菌属 (Calderobacterium ) 第 III 属 氢杆菌属 (Hydrogenobacter ) 第 IV 属 热发状菌属 (Thermocrinis )未定属第 I 属 脱硫杆状菌属 (Desulfurobacterium )4.第 BII 门 栖热袍菌门 (Thermotogae phy. nov.)第 I 纲 栖热袍菌纲 ( Thermotogae class. nov.) 第 I 目 栖热袍菌。