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是一类非细胞型微生物.ppt

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    • 病毒(virus)n n是一类非细胞型微生物是一类非细胞型微生物n n主要特点主要特点uu体积非常体积非常微小微小,需在,需在电子显微镜电子显微镜观察观察uu结构简单,结构简单,无细胞结构无细胞结构,只含一种类型核酸(,只含一种类型核酸(DNADNA或或RNARNA))uu严格的细胞内寄生严格的细胞内寄生,只能在活细胞中增殖,只能在活细胞中增殖uu对抗生素不敏感,但对干扰素敏感对抗生素不敏感,但对干扰素敏感 特性特性病毒病毒细菌细菌真菌真菌滤菌器滤菌器+ --结结 构构非细胞非细胞原核细胞原核细胞真核细胞真核细胞细胞壁细胞壁-++核酸类型核酸类型DNA或或RNADNA++RNADNA++RNA人工培养人工培养-++增殖方式增殖方式复制复制二分裂二分裂有性或无性有性或无性抗生素抗生素-++干扰素干扰素+-- 形态n n大小: (纳米,nm)uuThe largest : The largest : ((300X100 nm, 300X100 nm, 痘病毒痘病毒))uuThe smallest: 10 nm The smallest: 10 nm n n形态:球形或杆状,也有复合状 HIV Bacteriophage T4 结构n n基本结构基本结构uu核心核心     Viral core Viral core uu衣壳衣壳     Capsid Capsid n n辅助结构辅助结构uu包膜包膜   EnvelopeEnvelopeuu其他其他n n病毒体病毒体     VirionVirion   uu核衣壳核衣壳     NucleocapsidNucleocapsid 核心成分:成分:DNA 或或 RNA 病毒复制病毒复制功能功能 决定病毒的各种特性决定病毒的各种特性 具有感染性具有感染性 编码编码病毒结构蛋白和功能蛋白病毒结构蛋白和功能蛋白 病毒核酸的特性:病毒核酸的特性:具有具有具有具有感染性感染性感染性感染性将提纯的病毒核酸(如肠道病毒将提纯的病毒核酸(如肠道病毒将提纯的病毒核酸(如肠道病毒将提纯的病毒核酸(如肠道病毒RNARNA)如加至)如加至)如加至)如加至活细胞可以启动病毒复制从而感染细胞。

      从感染活细胞可以启动病毒复制从而感染细胞从感染活细胞可以启动病毒复制从而感染细胞从感染活细胞可以启动病毒复制从而感染细胞从感染细胞中可以获得子代完整病毒颗粒细胞中可以获得子代完整病毒颗粒细胞中可以获得子代完整病毒颗粒细胞中可以获得子代完整病毒颗粒 病毒衣壳n n成分:成分:成分:成分:蛋白质蛋白质uu由由壳粒壳粒组成壳粒是衣壳的形态学亚单位,多肽分组成壳粒是衣壳的形态学亚单位,多肽分子是衣壳的化学亚单位子是衣壳的化学亚单位n n功能功能uu保护病毒核酸保护病毒核酸uu参与感染过程参与感染过程uu具有抗原性具有抗原性 按壳粒排列方式的对称型n n螺旋对称型(螺旋对称型(helical symmetryhelical symmetry))n n2020面体立体对称型(面体立体对称型(icosahedralicosahedral symmetry symmetry))n n复合对称型(复合对称型(complex symmetrycomplex symmetry)) 病毒包膜n n是是包绕在病毒核衣壳外面的双层膜包绕在病毒核衣壳外面的双层膜n n主要成分是蛋白质、多糖及脂类,常以糖蛋白或脂蛋主要成分是蛋白质、多糖及脂类,常以糖蛋白或脂蛋白形式存在白形式存在n n蛋白质是由病毒基因编码,多糖、脂类来自宿主细胞蛋白质是由病毒基因编码,多糖、脂类来自宿主细胞膜膜、核膜或空泡膜、核膜或空泡膜 包膜特性与功能n n有包膜的病毒以有包膜的病毒以“ “出芽出芽”  ” 方式释放方式释放n n有包膜病毒对有包膜病毒对脂溶剂脂溶剂(如乙醚、氯仿)敏感,(如乙醚、氯仿)敏感,能灭活病毒,能灭活病毒,乙醚乙醚常用于鉴定病毒有无包膜常用于鉴定病毒有无包膜n n功能功能uu维护病毒体结构的完整性维护病毒体结构的完整性uu具有与宿主细胞膜亲和及融合的性能具有与宿主细胞膜亲和及融合的性能uu具有病毒抗原的特异性具有病毒抗原的特异性 病毒复制n n复制周期复制周期uu吸附、穿入、脱壳、生物合成、装配与释放吸附、穿入、脱壳、生物合成、装配与释放uu病毒本身没有独立的蛋白合成酶系统,必须借助宿病毒本身没有独立的蛋白合成酶系统,必须借助宿主细胞的蛋白合成体系合成病毒蛋白主细胞的蛋白合成体系合成病毒蛋白n n病毒复制周期时间因病毒而异病毒复制周期时间因病毒而异uu腺病毒   腺病毒   25h25huu小小RNARNA病毒 病毒 6-8h6-8huu流感病毒  流感病毒  15-30h15-30h dsDNA病毒复制示意图 +ssRNA病毒复制示意图 +ssRNA逆转录病毒复制示意图 吸附uu通过病毒体表面的配体蛋白与易感细胞表面通过病毒体表面的配体蛋白与易感细胞表面特异性受体相结合特异性受体相结合uu吸附过程可在几分钟到几十分钟内完成吸附过程可在几分钟到几十分钟内完成 穿入n n吞饮:无包膜病毒被宿主细胞吞噬,进入胞内n n融合:有包膜病毒的包膜与宿主细胞膜直接融合,病毒核衣壳进入细胞n n直接穿入: 脱壳n n在细胞溶酶体酶的作用下,脱去衣壳蛋白在细胞溶酶体酶的作用下,脱去衣壳蛋白释放病毒核酸释放病毒核酸 生物合成n n早期蛋白合成早期蛋白合成阶段阶段uu转录、翻译而产生病毒生物合成中必需的酶类及某转录、翻译而产生病毒生物合成中必需的酶类及某些抑制或阻断细胞核酸和蛋白质合成的非结构蛋白些抑制或阻断细胞核酸和蛋白质合成的非结构蛋白n n晚期蛋白合成晚期蛋白合成阶段阶段uu复制病毒核酸,转录、翻译而产生病毒的结构蛋白复制病毒核酸,转录、翻译而产生病毒的结构蛋白n n隐蔽期隐蔽期uu生物合成阶段用电镜方法在细胞查不到完整病毒,生物合成阶段用电镜方法在细胞查不到完整病毒,用血清学方法也测不到病毒抗原用血清学方法也测不到病毒抗原uu各病毒隐蔽期长短不一,各病毒隐蔽期长短不一, 装配n n无包膜病毒无包膜病毒uu先形成空心衣壳,核酸从衣壳裂隙进入形成核衣壳先形成空心衣壳,核酸从衣壳裂隙进入形成核衣壳n n有包膜病毒有包膜病毒uu核衣壳与细胞的膜系统(浆膜或核膜)结合形成包膜核衣壳与细胞的膜系统(浆膜或核膜)结合形成包膜uu包膜的蛋白质(包括糖蛋白)是包膜的蛋白质(包括糖蛋白)是由病毒基因组编码由病毒基因组编码,,故具有病毒的特异性和抗原性故具有病毒的特异性和抗原性n n装配的部位装配的部位uu除痘病毒外,除痘病毒外,DNADNA病毒病毒均在均在细胞核细胞核内装配内装配uuRNARNA病毒病毒与痘病毒则在与痘病毒则在细胞浆细胞浆内装配内装配 释放n n无包膜病毒uu均以破胞方式释放均以破胞方式释放n n有包膜的病毒uu以出芽方式释放到细胞以出芽方式释放到细胞外外uu通常细胞不死亡,仍能通常细胞不死亡,仍能继续分裂增殖继续分裂增殖 病毒增殖异常n n顿挫感染n n缺陷病毒n n干扰现象形成包涵体形成包涵体 某些病毒在宿主细胞内增殖,其细胞质或细胞核某些病毒在宿主细胞内增殖,其细胞质或细胞核内会出现一种光学显微镜下可见的斑块结构,称包涵内会出现一种光学显微镜下可见的斑块结构,称包涵体。

      它是病毒在细胞内增殖的场所体它是病毒在细胞内增殖的场所 顿挫感染n n原因uu宿主细胞宿主细胞不能提供不能提供病毒复制所需的病毒复制所需的酶、能量酶、能量或成份或成份uu病毒虽被复制,但病毒虽被复制,但不能装配释放不能装配释放 缺陷病毒n n因病毒因病毒基因组不完整基因组不完整或有点突变而不能进行正常或有点突变而不能进行正常复制的病毒,当与复制的病毒,当与辅助病毒辅助病毒共同培养,如能为其共同培养,如能为其提供缺乏的物质,则缺陷病毒也能培殖提供缺乏的物质,则缺陷病毒也能培殖uu腺病毒相关病毒腺病毒相关病毒(缺陷病毒)与腺病毒(辅助病毒)(缺陷病毒)与腺病毒(辅助病毒)uu丁型肝炎病毒(丁型肝炎病毒(缺陷病毒)与乙型肝炎病毒(辅助病缺陷病毒)与乙型肝炎病毒(辅助病毒)毒) 干扰现象n n两种病毒感染同一细胞时,一种病毒会干扰另一病毒复制n n原因uu与干扰素(与干扰素(IFNIFN))产生有关产生有关uu病毒改变了宿病毒改变了宿   主细胞代谢途径主细胞代谢途径n n意义uu联合使用疫苗联合使用疫苗 理化因素对病毒的影响n n灭活uu病毒受理化因素作用后,失去感染性病毒受理化因素作用后,失去感染性uu灭活病毒仍保留某些特性,如抗原性、红细灭活病毒仍保留某些特性,如抗原性、红细胞吸附、细胞融合等胞吸附、细胞融合等 物理因素n n温度温度uu病毒耐冷不耐热。

      病毒耐冷不耐热70ºC-70ºC长期保存冻融可杀死病长期保存冻融可杀死病毒毒uu60ºC 30 min60ºC 30 min或或100ºC100ºC数秒数秒即可杀死病毒,但即可杀死病毒,但HBVHBV需需100ºC 10 min100ºC 10 min方可方可杀死杀死uu有包膜病毒比无包膜病毒对热更敏感有包膜病毒比无包膜病毒对热更敏感n npHpHuu多数在多数在pH 5~9pH 5~9范围稳定范围稳定uu肠道病毒耐酸(肠道病毒耐酸(pH 3~5pH 3~5))n n射线射线          X X线、线、 射线可将病毒核酸致死性断裂,从而杀死病毒射线可将病毒核酸致死性断裂,从而杀死病毒 化学因素n n脂溶剂:乙醚、氯仿、去氧胆酸盐脂溶剂:乙醚、氯仿、去氧胆酸盐uu有包膜病毒敏感有包膜病毒敏感有包膜病毒敏感有包膜病毒敏感无包膜病毒无作用(如肠道病毒)无包膜病毒无作用(如肠道病毒)n n消毒剂:过氧乙酸、甲醛、戊二醛、卤素消毒剂:过氧乙酸、甲醛、戊二醛、卤素uu杀死大多数病毒,但杀死大多数病毒,但病毒对消毒剂抵抗力比细菌强,病毒对消毒剂抵抗力比细菌强,尤其是无包膜病毒尤其是无包膜病毒uu常用甲醛来制备灭活疫苗常用甲醛来制备灭活疫苗n n其他其他uu抗生素:对病毒无作用抗生素:对病毒无作用抗生素:对病毒无作用抗生素:对病毒无作用uu中草药:有一定作用中草药:有一定作用 n n病毒的变异现象uu感染性变异(毒力变异)感染性变异(毒力变异)•条件致死株:减毒活疫苗(脊灰)条件致死株:减毒活疫苗(脊灰)uu抗原性变异抗原性变异uu耐药性变异耐药性变异n n机制机制      基因突变    基因重组基因突变    基因重组 病毒与其他微生物的比较特特                性性病病      毒毒细细      菌菌支支   原原   体体立克次体立克次体衣衣     原原     体体大小大小( ( m)m)0.01-0.01-0.30.30.5-3.00.5-3.00.2-3.00.2-3.00.2-0.50.2-0.50.3-0.50.3-0.5结结                构构非细胞非细胞单细胞单细胞类似细菌类似细菌近似细菌近似细菌介于细胞和病毒介于细胞和病毒细细     胞胞     壁壁——十十——十十十十核酸类型核酸类型D / RD / RD D 十十   R RD D 十十   R RD D 十十   R RD D 十十   R R人工培养基人工培养基——十十十十————二分裂增殖二分裂增殖——十十十十十十十十核核     糖糖     体体——十十十十十十十十抗生素敏感抗生素敏感——十十十十十十十十干抗素干抗素敏感敏感十十———————— 小结n n病毒的概念n n病毒的结构与化学组成n n病毒的复制n n理化因素对病毒的影响 14. Techniques used to Study Virusesn nLiving hosts. Man. n nPasteur used rabbits to study and develop rabies vaccines.n nWalter Reed developed a mouse model of yellow fever.n nTransgenic animals, particularly mice invaluable•Embryonated eggs used to propagate viruses in the early decades of this century. Effective for the isolation & culture of many viruses e.g.influenza. 15. Cell Culture methodsn nWholeWhole organ cultures organ cultures, progressed to methods , progressed to methods involving individual cells; involving individual cells; primary cell culturesprimary cell cultures   which can be maintained for a short period in which can be maintained for a short period in culture); or culture); or immortalized cell linesimmortalized cell lines, which grow in , which grow in culture indefinitely. Viruses can be grown in them.culture indefinitely. Viruses can be grown in them. 16. Quantifying viruses. n nThe plaque assay - dilutions of the virus are used to infect a cultured cell monolayer, covered with agar to restrict virus diffusion virus. Results in localized cell killing & the appearance of plaques. The number of plaques directly relates to numbers of infectious virus particles applied to the plate.n nMany other approaches.  17. Other practical approachesn nSerologyn nStructural studies, purification, EM, X-ray.n nBiochemical, electrophoresisn nGeneticn nMolecular biology, nucleic acid sequencing.  Replication 14. Exitn nSome viruses cause cell lysis. Unenveloped.Some viruses cause cell lysis. Unenveloped.n nOther viruses bud through a cell membrane, Other viruses bud through a cell membrane, aquiring an envelope. Can be the plasma membrane aquiring an envelope. Can be the plasma membrane e.g. HIV-1. Can be nuclear or golgi membranes. e.g. HIV-1. Can be nuclear or golgi membranes.  2. Big fleas have little fleas upon their backs to bite them; and little fleas have lesser fleas and so ad infinitum.n nViruses consist of proteins, nucleic acids and Viruses consist of proteins, nucleic acids and sometimes lipids. However there are other infectious sometimes lipids. However there are other infectious agents studied by virologists.agents studied by virologists.n nViroiViroidsds small (200-400nt), circular  small (200-400nt), circular RNAsRNAs, possessing , possessing no capsid or envelope. Associated with certain plant no capsid or envelope. Associated with certain plant diseases. They are infectious obligate intracellular diseases. They are infectious obligate intracellular parasites. parasites. n nVirusoidsVirusoids are satellite,  are satellite, viroidviroid-like -like RNAsRNAs, larger than , larger than viroidsviroids (approximately 1000nt). Depend on the  (approximately 1000nt). Depend on the presence of virus replication for multiplication (hence presence of virus replication for multiplication (hence 'satellite'), they are packaged into virus 'satellite'), they are packaged into virus capsidscapsids as  as passengers. Present in animals and plants.passengers. Present in animals and plants. Associated with disease.   3. Prionsn nPrions. “pree ons” believed to consist of a single type of protein with no nucleic acid component. The prion protein & the gene which encodes it are also found in normal 'uninfected' cells. n nThese agents are associated with infectious and inherited diseases, such as Creutzfeldt-Jakob disease in humans, scrapie in sheep & bovine spongiform encephalopathy (BSE) in cattle.  –ve RNA-ve RNApolProteins-ve RNA+ve RNARI Genomes 14Ambisense Genomesn nSome ssRNA viruses are ambisense, since they are part (-)sense & part (+)sense: 5’ ends are +ve, 3’ ends are –ve. Genomes 15. Segmented/multipartite.n nCan be confusing, ss or ds. n nSegmented genomes have 2 or more pieces of nucleic acid packaged in the same particle e.g orthomxyo viruses.(7/8 in flu, packaging problem)n nMultipartite genomes are segmented but each segment is contained in a different particle e.g bipartite Comoviruses, both particles infect cell. segmentedMultipartite, DNA as well Genomes 16. DNA.n nSmall genomes e.g.bacteriophage M13n n6.4 Kb ss circular DNA. 10 genesn nBy convention genome is +strand.n n90% genome is coding. + RF-strand transcribed to make mRNAand then proteins +ve strand nickedextended in rolling circle + Specifically cleavedAnd recircularised Genomes 17. Phage l. n nLinear ds DNA about 50Kb.n nCohesive ss DNA termini 12 nucleotides long, the cos site. Facilitates circularisation and replication cycle. Concatemers formed and then resolved to reconstitute genome.                  ’TCCAGCGGCGGG’TCCAGCGGCGGG                                                                                                                                                      AGGTCGCCGCCC3’AGGTCGCCGCCC3’ limportant sequences at the end of the linear virus genomes are a very common feature. Genomes 18. Phage T4n nLarge linear ds DNA 160Kbn nGenome exhibits terminal redundancy. Another common feature of linear genomes.  A B C D E A B C D E A B C D E A B C D EA B C D E A B C D E A B C D E A B C D En nDuring replication concatemers are formed. Endonuclease recognises and cuts at this terminal redundancy, which is then regenerated.   Genomes 19. n nTranscriptional control in prokaryotes is Transcriptional control in prokaryotes is sophisticated. That said extensive use of sophisticated. That said extensive use of polycistronicpolycistronic mRNAs is made. mRNAs is made.n nGenomes are denseGenomes are densen nM13 10 genes, 10 transcripts 90% usageM13 10 genes, 10 transcripts 90% usagen nGenomes of eukaryotes are denserGenomes of eukaryotes are densern nPolyomaPolyoma,  , dsds DNA circular 5kb genome DNA circular 5kb genomen nSix genes, both strands, overlapping.Six genes, both strands, overlapping. Genomes 20. Adeno virusesn nLarger 30-38kb linear ds genomes infecting eukaryotes. Code for about 30-40 proteinsn nThese viruses are genetically very similar to the host cells which they infect.n nTerminal sequences are inverted repeatsn nComplicated functional structures can form at these pointsTGTGTGCACACAACACACGTGTGT Viral Replication. n nAttachment and penetrationn nUncoating, nucleic acid and protein synthesisn nAssembly and exit.  Replication 2.n nParticle/infectivity ratio can be low. Sometimes only 1 in 1000 virions are infectious.n nIt makes the study of replication difficult because most infections are abortive. n nStudy of synchronously infected cells is useful. Replication 3. n nEclipse phase: low amounts of parental infectious material present. Genome replication has been initiated. Duration, minutes-hrs. Replication 4. n nMaturation phase:viral material accumulates in cell Maturation phase:viral material accumulates in cell or surrounding medium. Cells infected with or surrounding medium. Cells infected with lyticlytic virusesviruses become metabolically disordered and die,  become metabolically disordered and die, viral production ceases. Titres slowly drop. Cells viral production ceases. Titres slowly drop. Cells infected with infected with non non lyticlytic viruses can continue to  viruses can continue to produce viral particles indefinitely. produce viral particles indefinitely.  Replication 5. n nReproductive cycle less than an hour with many Reproductive cycle less than an hour with many bacteriophagebacteriophage, 6-8hrs in , 6-8hrs in picornaviridaepicornaviridae and more than  and more than 40 hrs in 40 hrs in herpesviridaeherpesviridae.  . n nCells infected with polio virus can yield more than Cells infected with polio virus can yield more than 100000 copies of virus per infected cell.100000 copies of virus per infected cell. Replication 6.n nInfection may be: Infection may be: n nproductiveproductive, i.e. entry into , i.e. entry into permissivepermissive cells followed  cells followed by by virionvirion formation.  formation. n nabortiveabortive, i.e. entry into a non permissive cell which , i.e. entry into a non permissive cell which does not result in does not result in virionvirion formation; there can be  formation; there can be many reasons for non-permissiveness e.g. no many reasons for non-permissiveness e.g. no receptor.receptor.n nrestringentrestringent or restrictive or restrictive, cell is transiently , cell is transiently permissive and a few virus are produced. Virus permissive and a few virus are produced. Virus production stops but the genome remains in the production stops but the genome remains in the cell, examples include Epstein Barr Virus and cell, examples include Epstein Barr Virus and herpes simplex virus. This kind of infection may still herpes simplex virus. This kind of infection may still have serious consequences e.g cell transformation have serious consequences e.g cell transformation and cancer. and cancer.  History of Virologyn nViruses are probably as old as life on earth. Ancients were aware of viral diseasesPerhaps the first written record of a virus infection consists of a heiroglyph from Memphis, drawn in approximately 1400BC, which depicts a temple priest called Siptah showing typical clinical signs of paralytic poliomyelitis n nSmallpox, endemic in Smallpox, endemic in China by 1000BC. China by 1000BC. Recognizing that Recognizing that survivors of smallpox survivors of smallpox outbreaks were outbreaks were protected from protected from subsequent infection, subsequent infection, the practice of the practice of variolationvariolation   developed. Involved developed. Involved inhalation of dried inhalation of dried crusts from smallpox crusts from smallpox lesions, or in later lesions, or in later modifications, modifications, inoculation of the pus inoculation of the pus from a lesion into a from a lesion into a scratch on the scratch on the forearm. Practice forearm. Practice survived until this survived until this century. century.  On On May 14, 1796, May 14, 1796, Edward JennerEdward Jenner used  used cowpox-infected cowpox-infected material obtained from material obtained from the hand of Sarah the hand of Sarah NemesNemes, a milkmaid , a milkmaid from Berkley in from Berkley in Gloucestershire to Gloucestershire to vaccinate 8 year old vaccinate 8 year old James Phipps. On James Phipps. On July July 1, 17961, 1796, Jenner , Jenner challenged the boy by challenged the boy by deliberately inoculating deliberately inoculating him with material from him with material from a real case of smallpox a real case of smallpox !  ! He did not become He did not become infected!infected! n nIn In 18921892,  , Dmitri Dmitri IwanowskiIwanowski, a Russian botanist, , a Russian botanist, showed that extracts from diseased showed that extracts from diseased tobaccotobacco   plants could transmit disease to other plants plants could transmit disease to other plants after passage through ceramic filters fine after passage through ceramic filters fine enough to retain the smallest known bacteria. enough to retain the smallest known bacteria. Generally recognised as the beginning of Generally recognised as the beginning of Virology Virology n nIn In 18981898,  , MartinusMartinus BeijerinickBeijerinick confirmed &  confirmed & extended extended Iwanowski'sIwanowski's results on  results on tobacco mosaic tobacco mosaic virusvirus & was the first to develop the modern idea  & was the first to develop the modern idea of the virus, which he referred to as of the virus, which he referred to as contagiumcontagium   vivumvivum   fluidumfluidum ('soluble living germ') ('soluble living germ') nnCompiled from 'Virus Taxonomy', the Sixth Report of Compiled from 'Virus Taxonomy', the Sixth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) 1995. N.B: you can search this document using (ICTV) 1995. N.B: you can search this document using the "Find" command of the browser (Edit Menu)the "Find" command of the browser (Edit Menu)nn63U-11 virus, 63U-11 virus, BunyaviridaeBunyaviridae75V-2374 virus, 75V-2374 virus, BunyaviridaeBunyaviridae75V-2621 virus, 75V-2621 virus, BunyaviridaeBunyaviridae78V-2441 virus, 78V-2441 virus, BunyaviridaeBunyaviridae   nnAbadinaAbadina virus,  virus, ReoviridaeReoviridaeAbelsonAbelson   murinemurine   leukemialeukemia virus,  virus, RetroviridaeRetroviridaeAbrasAbras virus,  virus, BunyaviridaeBunyaviridaeAbraxasAbraxas   grossulariatagrossulariata   cypoviruscypovirus 8,  8, ReoviridaeReoviridaeAbraxasAbraxas   grossulariatagrossulariata NPV,  NPV, BaculoviridaeBaculoviridaeAbsettarovAbsettarov virus,  virus, FlaviviridaeFlaviviridaeAbu Abu HammadHammad virus,  virus, BunyaviridaeBunyaviridaeAbu Mina virus, Abu Mina virus, BunyaviridaeBunyaviridaeAbutilon mosaic virus, Abutilon mosaic virus, GeminiviridaeGeminiviridaeAcadoAcado virus,  virus, ReoviridaeReoviridaeAcalyphaAcalypha yellow mosaic virus,  yellow mosaic virus, GeminiviridaeGeminiviridaeAcantholydaAcantholyda   erythrocephalaerythrocephala NPV,  NPV, BaculoviridaeBaculoviridaeAcaraAcara virus,  virus, BunyaviridaeBunyaviridaeAcciptridAcciptrid   herpesvirusherpesvirus 1,  1, HerpesviridaeHerpesviridaeAchaea Achaea janatajanata NPV,  NPV, BaculoviridaeBaculoviridaeAcherontiaAcherontia   atropasatropas virus,  virus, TetraviridaeTetraviridaeAchetaAcheta   domesticadomestica   densovirusdensovirus,  , ParvoviridaeParvoviridaeAcholeplasmaAcholeplasma phage Oc1r,  phage Oc1r, InoviridaeInoviridaeAcholeplasmaAcholeplasma phage 10tur,  phage 10tur, InoviridaeInoviridaeAcholeplasmaAcholeplasma phage L2,  phage L2, PlasmaviridaePlasmaviridaeAcholeplasmaAcholeplasma phage L51,  phage L51, InoviridaeInoviridaeAcholeplasmaAcholeplasma phage M1,  phage M1, PlasmaviridaePlasmaviridaeAcholeplasmaAcholeplasma phage MV-L1,  phage MV-L1, InovindaeInovindaeAcholeplasmaAcholeplasma phage MVG51,  phage MVG51, InoviridaeInoviridaeAcholeplasmaAcholeplasma phage 01,  phage 01, PlasmaviridaePlasmaviridaeAcholeplasmaAcholeplasma phage  phage vl vl,  , PlasmaviridaePlasmaviridaeAcholeplasmaAcholeplasma phage v2,  phage v2, PlasmaviridaePlasmaviridaeAcholeplasmaAcholeplasma phage v4,  phage v4, PlasmaviridaePlasmaviridaeAcholeplasmaAcholeplasma phage v5,  phage v5, PlasmaviridaePlasmaviridaeAcholeplasmaAcholeplasma phage v7,  phage v7, PlasmaviridaePlasmaviridaeAchroiaAchroia   grisellagrisella NPV,  NPV, BaculoviridaeBaculoviridaeAcidaliaAcidalia   carticcariacarticcaria NPV,  NPV, BaculoviridaeBaculoviridaeAclerisAcleris   gloveranagloverana NPV,  NPV, BaculoviridaeBaculoviridaeAclerisAcleris   varianavariana NPV,  NPV, BaculoviridaeBaculoviridaeAcrobasisAcrobasis   zellerizelleri   entomopoxvirusentomopoxvirus,  , PoxviridaePoxviridaeAcronictaAcronicta   acerisaceris NPV,  NPV, BaculoviridaeBaculoviridaeActebiaActebia   fennicafennica NPV,  NPV, BaculoviridaeBaculoviridaeActiasActias   seleneselene   CypovirusCypovirus 4,  4, ReoviridaeReoviridaeActiasActias   seleneselene NPV,  NPV, BaculoviridaeBaculoviridaeActinomycetesActinomycetes phage 108/016,  phage 108/016, MyoviridaeMyoviridaeActinomycetesActinomycetes phage 119,  phage 119, SiphoviridaeSiphoviridaeActinomycetesActinomycetes phage A1-Dat,  phage A1-Dat, SiphoviridaeSiphoviridaeActinomycetesActinomycetes phage  phage BirBir,  , SiphoviridaeSiphoviridaeActinomycetesActinomycetes phage f115-A,  phage f115-A, SiphoviridaeSiphoviridaeActinomycetesActinomycetes phage f150A,  phage f150A, SiphoviridaeSiphoviridaeActinomycetesActinomycetes phage f31C,  phage f31C, SiphoviridaeSiphoviridae•Actinomycetes phage M1, SiphoviridaeActinomycetes phage MSP8, SiphoviridaeActinomycetes phage P-a-1, SiphoviridaeActinomycetes phage R1, SiphoviridaeActinomycetes phage R2, SiphoviridaeActinomycetes phage SK1, MyoviridaeActinomycetes phage SV2, SiphoviridaeActinomycetes phage VP5, SiphoviridaeAdelaide River virus, RhabdoviridaeAdeno-associated virus 1, ParvoviridaeAdeno-associated virus 2, ParvoviridaeAdeno-associated virus 3, ParvoviridaeAdeno-associated virus 4, ParvoviridaeAdeno-associated virus 5, ParvoviridaeAdisura atkinsoni NPV, BaculoviridaeAdoxophyes orana NPV, BaculoviridaeAedes aegypti densovirus, ParvoviridaeAedes aegypti entomopoxvirus, PoxviridaeAedes aegypti NPV, BaculoviridaeAedes albopictus densovirus, ParvoviridaeAedes annandalei NPV, BaculoviridaeAedes atropalpus NPV, BaculoviridaeAedes epactius NPV, BaculoviridaeAedes nigromaculis NPV, BaculoviridaeAedes pseudoscutellaris densovirus, ParvoviridaeAedes scutellaris NPV, BaculoviridaeAedes sollicitans NPV, BaculoviridaeAedes taeniorhynchus NPV, BaculoviridaeAedes tormentor NPV, BaculoviridaeAedes triseriatus NPV, BaculoviridaeAedia leucomelas NPV, BaculoviridaeAeromonas phage 29, MyoviridaeAeromonas phage 37, MyoviridaeAeromonas phage 43, MyoviridaeAeromonas phage 44RR2.8t, MyoviridaeAeromonas phage 51, MyoviridaeAeromonas phage 59.1, MyoviridaeAeromonas phage 65, MyoviridaeAeromonas phage Aeh1, MyoviridaeAeromonas phage Aeh2, MyoviridaeAfrican cassava mosaic virus, GeminiviridaeAfrican green monkey cytomegalovirus, HerpesviridaeAfrican green monkey HHV-like virus, HerpesviridaeAfrican green monkey polyomavirus, PapovaviridaeAfrican horse sickness viruses 1 to 10, ReoviridaeAfrican swine fever virus, African swine fever-like virusesAG83-1746 virus, BunyaviridaeAG83-497 virus, BunyaviridaeAgaricus bisporus virus 1, UnassignedAgaricus bisporus virus 4, PartitiviridaeAgraulis vanillae virus, TetraviridaeAgrobacterium phage PIIBNV6, MyoviridaeAgrobacterium phage PS8, SiphoviridaeAgrobacterium phage PT11, SiphoviridaeAgrobacteriurn phage Y, SiphoviridaeAgrochola helvolva cypovirus 6, ReoviridaeAgrochola lychnidis cypovirus 6, ReoviridaeAgropyron mosaic virus, PotyviridaeAgrotis exclarnationis NPV, BaculoviridaeAgrotis ipsilon NPV, BaculoviridaeAgrotis segeturn cypovirus 9, ReoviridaeAgrotis segeturn NPV, BaculoviridaeAguacate virus, BunyaviridaeAhlum water-borne virus, TombusviridaeAino virus, BunyaviridaeAkabane virus, BunyaviridaeAKR (endogenous) murine leukemia virus, RetroviridaeAlabama argillacea NPV, BaculoviridaeAlajuela virus, BunyaviridaeAlcaligenes phage 8764, SiphoviridaeAlcaligenes phage A5/A6, SiphoviridaeAlcaligenes phage A6, MyoviridaeAlcelaphine herpesvirus 1, HerpesviridaeAlcelaphine herpesvirus 2, HerpesviridaeAlenquer virus, BunyaviridaeAletia oxygala NPV, BaculoviridaeAleutian disease virus, ParvoviridaeAleutian mink disease virus, ParvoviridaeAfalfa cryptic virus 1, PartitiviridaeAlfalfa cryptic virus 2, PartitiviridaeAlfalfa latent virus, CarlavirusAlfalfa mosaic virus, BromoviridaeAlfuy virus, FlaviviridaeAllerton virus, HerpesviridaeAlligatorweed stunting virus, ClosterovirusAllitrich herpesvirus 1, HerpesviridaeAllomyces arbuscula virus, UnassignedAlmeirim virus, ReoviridaeAlmpiwar virus, RhabdoviridaeAlphaea phasma NPV, BaculoviridaeAlsophila pometaria NPV, BaculoviridaeAlstroemeria mosaic virus, PotyviridaeAlstroemeria streak virus, PotyviridaeAlstroemeria virus, CarlavirusAltamira virus, ReoviridaeAlteromonas phage PM2, CorticoviridaeAmapari virus, ArenaviridaeAmaranthus leaf mottle virus, PotyviridaeAmathes c-nigrum NPV, BaculoviridaeAmazon lily mosaic virus, PotyviridaeAglais urticae cypovirus 2, ReoviridaeAglais urticae cypovirus 6, ReoviridaeAglais urticae NPV, BaculoviridaeAgraulis vanillae cypovirus 2, ReoviridaeAgraulis vanillae densovirus, ParvoviridaeAgraulis vanillae NPV, BaculoviridaeAndraca bipunctata GV, BaculoviridaeAneilema virus, PotyviridaeAngel fish reovirus, ReoviridaeAnhanga virus, BunyaviridaeAnhembi virus, BunyaviridaeAnisota senatoria NPV, BaculoviridaeAnomala cuprea entomopoxvirus, PoxviridaeAnomis flava NPV, BaculoviridaeAnomis sabulifera NPV, BaculoviridaeAnomogyna elimata NPV, BaculoviridaeAnopheles A virus, BunyaviridaeAnopheles 8 virus, BunyaviridaeAnopheles crucians NPV, BaculoviridaeAntequera virus, BunyaviridaeAnthela varia NPV, BaculoviridaeAnthelia hyperborea NPV, BaculoviridaeAntheraea eucalypti virus, TetraviridaeAntheraea mylitta cypovirus 4, ReoviridaeAntheraea paphia NPV, BaculoviridaeAntheraea pemyi cypovirus 4, ReoviridaeAntheraea pemyi NPV, BaculoviridaeAntheraea polyphemus NPV, BaculoviridaeAntheraea yamamai NPV, BaculoviridaeAnthonomus glandis PV, BaculoviridaeAnthoxan, thum latent blanching virus, HordeivirusAnthoxanthum mosaic virus, PotyviridaeAnthrenus museorum NPV, BaculoviridaeAnthriscus virus, CarlavirusAnthriscus yellows virus, SequiviridaeAnticarisia gemmatalis MNPV, BaculoviridaeAntitype xanthomista cypovirus 6, ReoviridaeAotine herpesvirus 1, HerpesviridaeAotine herpesvirus 2, HerpesviridaeAotine herpesvirus 3, HerpesviridaeApamea anceps GV, BaculoviridaeApamea anceps NPV, BaculoviridaeApamea sordens GV, BaculoviridaeApanteles fumiferanae virus, PolydnaviridaeApeu virus, BunyaviridaeAphid lethal paralysis virus, PicornaviridaeAphodius tasmaniae entomopoxvirus, PoxviridaeApocheima cinerarius NPV, BaculoviridaeApproved Names of All Known Viruses: There are thousands Serious ThreatennWalter Reed discovered the first human virus –Yellow fever virus In 1901nHBV was discovered during 1963 to 1970. It turned out to be the most serious health problem in ChinanWHO declared the deracination of Small Pox In 1980nAIDS patients were reported in USA In 1981. The HIV was recognised in 1983nThere are maybe still a lot of viruses we don’t know Helical Capsidsn nHelix can be defined mathematically by two Helix can be defined mathematically by two parameters: parameters: amplitudeamplitude   (diameter)(diameter)  &   & pitchpitch (the (the   distance distance covered by each complete turn of the covered by each complete turn of the helix)  helix)   Icosahedran n20 20 equilateral equilateral triangles triangles arranged into a arranged into a sphere based sphere based on on 2-3-5 rotational symmetryn nBacteriophage Bacteriophage ØX174.ØX174. As simple as As simple as it comes. 60 identical it comes. 60 identical subunits form a subunits form a capsid. 3 protein capsid. 3 protein subunits per triangular subunits per triangular face. Most have more.face. Most have more.    Complicated Virus Structures 病毒立体对称结构(Symmetry)n n二十面体立体对称((IcosahedralIcosahedral):):球形病毒的核球形病毒的核衣壳形态。

      衣壳形态n n螺旋对称((HelicalHelical):衣壳壳粒):衣壳壳粒螺旋状排列包裹核酸,多数有包螺旋状排列包裹核酸,多数有包膜n n复合对称((ComplexComplex):):既有二既有二十面体立体对称结构,也有螺旋十面体立体对称结构,也有螺旋对称结构,如噬菌体对称结构,如噬菌体 病毒的结构n n基本结构基本结构uu核酸:核酸:DNADNA或者或者RNARNA,,线性或环状,完整或分段线性或环状,完整或分段uu衣壳(衣壳(CapsidCapsid):):包裹病毒基因组的蛋白质包裹病毒基因组的蛋白质FF核衣壳(核衣壳(NucleocapsidNucleocapsid))= Capsid +  nucleic acid= Capsid +  nucleic acid. .FF结构单位结构单位(Structural units): (Structural units): 衣壳衣壳基本的蛋白结构单位基本的蛋白结构单位FF壳粒壳粒( (CapsomersCapsomers): ): 电镜下电镜下病毒表面的最小形态结构病毒表面的最小形态结构n n辅助结构辅助结构uu包膜(包膜(EnvelopeEnvelope):):是脂质是脂质液态双层生物膜,是病毒出芽释液态双层生物膜,是病毒出芽释放时局部细胞膜包裹病毒衣壳即成胞膜,但包膜上含有病毒特异蛋放时局部细胞膜包裹病毒衣壳即成胞膜,但包膜上含有病毒特异蛋白分子,如一些病毒的糖蛋白。

      白分子,如一些病毒的糖蛋白。

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