引物设计列表——【RT-PCR技术】.pdf

旗开得胜 读万卷书 行万里路 1 qRT-PCR: 1、引物设计不求人！手把手教你设计 RT-qPCR 引物！（Premier 6.0） s:mp.weixin./s/5oUZ12qHvhiZt9AYV3nRZA 2、科研干货丨教你一分钟搞定 qPCR 引物设计（，human 以及多种模式生物， lncRNA 也可） s:mp.weixin./s/6XtKPxOpvDxQv3PYnH9DMA 3、绝不骗你！RT-qPCR 引物设计 5 秒就够了！（PrimerBank） s:mp.weixin./s/znn5qIQDIWH4x1FhVaIwfQ 4、这些 qPCR 引物设计的骚操作，你造么？（几个引物设计） s:mp.weixin./s/x3lNbeNfW5bAL5x6g_-HZQ 5、如何快准狠设计 PCR 引物（NCBI） s:mp.weixin./s/iAhB2mQ4r8HNTh-4wZn6zg mRNA 引物设计 mRNA 引物设计（NCBI 网站） mRNA 引物设计（Universal ProbeLibrary 网站） mRNA 引物设计（PrimerBank 网站） mRNA 引物设计（Primer3Input 网站） mRNA 引物设计（GenScript Real-time PCR (TaqMan) Primer Design 网 站） mRNA 引物设计（Primer Premier 6.0 软件） mRNA 引物设计（Oligo 7.0 软件） 旗开得胜 读万卷书 行万里路 2 lncRNA 引物设计（不同数据库获得序列） 1.NONCODE： 提供对长链非编码 RNA 的全面注释， 包括表达和该团队 开发的 ncFANs 计算机软件预测的 lncRNA 功能。

这是非编码 RNA 研 究的知名数据库，已经更新到 2014 年的 8 月了网站：:noncode.org 2.lncRNAdb:提供有生物学功能的长链非编码 RNA 的全面注释这是 长链非编码 RNA 研究领域的大牛 John mattick 实验室构建的网站网 站：:lncrnadb.org/ 3.CHIPbase：提供长链非编码 RNA 的表达图谱和转录调控的全面鉴定 和注释整合了高通量的 RNA-seq 鉴定的 lncRNA 及其表达图谱和 ChIP-Seq实 验 技 术 鉴 定 的 转 录 因 子 结 合 位 点 网 站：:deepbase.sysu.edu/chipbase/ 4.LncRNome： 超过 18000 转变本目前已作为 lncRNA 标注， 覆盖先前 注释非编码转录本，包括大型基因间非编码 RNA，反义 RNA 和加工的 假基因但在提供稳定的注释，交叉引用和生物相关的信息资源方面有 显着的差距由印度 CSIR 基因组和整合生物学研究所研究人员开发的 lncRNome， 旨在填补这一空白， 他们通过把生物显著性的各种各样的信 息注释整合到一个全面的知识库。

数据库 URL：:genome.igib.res.in/lncRNome 5.Starbase：一个高通量实验数据 CLIP-Seq（或称为 HITS-CLIP,PAR- CLIP,iCLIP） 和 mRNA 降解组测序数据支持的 microRNA 靶标数据库,包 含了 miRNA-mRNA，miRNA-lncRNA，miRNA-circRNA，miRNA- 旗开得胜 读万卷书 行万里路 3 ceRNA 和 RNA-protein 等的调控关系整合和构建多个流行的靶标预 测软件的交集和调控关系网址：:starbase.sysu.edu/ 6. LncRNADisease: 提供了文献报道的疾病相关的长链非编码 RNA 的 注释网站：:cmbi.bjmu.edu/lncrnadisease 7.lncRNA 引物设计和研究 LncRNA 不得不学的数据库！（几个 LncRNA 数据库） s:mp.weixin./s/sEyc7-Q9Jmh8Hz6ZZyaJAw circRNA 引物设计（不同数据库+Premier 5.0 软件） 1.circBase，收集和整合已经发布的 circRNA 数据构建的数据库。

网址：:circbase.org/ 2.circBank，整合已发布的人类 circRNA 的数据库 网址：:circbank/ 3.circRNABase，整合已发表的 circRNA 数据，构建 miRNA 与 circRNA 以及 circRNA 与 RNA 结合蛋白（RBP)的互作网络 网址：:starbase.sysu.edu/mirCircRNA.php 4.deepBase，包含了大约 15 万的 circRNA 基因（人、鼠、果蝇、线虫等），构 建了最全面的 circRNA 的表达图谱 网址：:deepbase.sysu.edu/ 5.Circ2Traits，是一个收集与疾病或性状相关的 circRNA 数据库 网址：:gyanxet-beta/circdb/ 6.circNet，里面收录了一些 circ-miRNA-gene 网络，以及测序数据 网址：:circnet.mbc.nctu.edu.tw/ 7.CSCD，癌特异环状 RNA 数据库 旗开得胜 读万卷书 行万里路 4 网址：:gb.whu.edu/CSCD/ 8、其他 circRNA 数据库和引物设计方法 9、circRNA: 技术贴丨 CircRNA 特异性引物设计方法 s:mp.weixin./s/BlQtb1TrcWoJ2gtXWNdeXQ s:wenku.baidu/view/9ec45c28b42acfc789eb172ded630b1c59ee9b7d.html 引物设计工具： 1、引物设计软件哪家强？快速获取有门道 s:mp.weixin./s/hdBaN43mV7pGgToG_Jh7xg 2、常用引物设计工具大集合 s:mp.weixin./s/k0ScDSBbLJzC4bo382cz4A 。