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森林草莓糖基转移酶基因家族生物信息学及其表达分析.docx

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  • 卖家[上传人]:天****步
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  • 上传时间:2022-03-28
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    • 本文格式为Word版,下载可任意编辑森林草莓糖基转移酶基因家族生物信息学及其表达分析 0.05)FvUFGT67和FvUFGT68基因在根中有较高表达;FvUFGT33基因在森林红果的果实中有较高表达,在森林白果的果实中有极低表达;FvUFGT95和FvUFGT96基因在果实中有表达,显著高于其他组织本研究通过实时荧光定量PCR分析森林草莓果实小绿期、转色期和成熟期的表达变化,结果(图7)显示,随着果实的生长,FvUFGT基因的表达模式不同其中,FvUFGT33基因在森林红果中随着果实生长,其表达量越来越高,在成熟期达最高值,而其在森林白果整个果实发育阶段表达量相对极低或不表达;FvUFGT95基因在草莓红果中的相对表达量一向呈上升趋势,而在森林白果中的相对表达量呈先上升后下降;在成熟期,FvUFGT33和FvUFGT95基因在森林红果中的相对表达量显著高于森林白果 3 议论 本研究通过Phytozome数据库在森林草莓中获得138个FvUGT基因,察觉FvUGT基因家族成员总数较黄瓜(85)和拟南芥(107)多(Li et al.,2022),但比茶(132)、梨(139)、玉米(147)、桃(168)、毛杨果(178)、小麦(179)、水稻(180)、葡萄(181)和苹果(241)等作物中的UGT成员少(Caputi et al.,2022;Li et al.,2022;Cui et al.,2022;Wu et al.,2022;He et al.,2022)。

      在不同物种中,UGT家族成员的数量不同,可能与每个物种基因组中预料的基因总数和基因组总大小有关(Caputi et al.,2022)本研究察觉,FvUGT基因家族基因在除2号染色体外的其他6条染色体上均有分布,且在染色体上分散分布在拟南芥和棉花中也察觉类似的UGT基因家族基因分布模式(Li et al.,2022;Huang et al.,2022)内含子虽然对蛋白氨基酸序列无付出,但其位置和数量会影响蛋白多样性和整体细胞功能通过内含子的相对位置可预料某些线索,包括基因及其编码蛋白进化关系,并进一步促进基因家族的多样化(Rogozin et al.,2000;Li et al.,2022)本研究中,138个FvUGT基因的内含子数量不同(1~28),其中内含子数目最多的是FvUGT4基因,为28个,其基因的布局也最繁杂在138个已鉴定的FvUGT基因中,有39%缺乏内含子,与于拟南芥、亚麻和玉米的报道一致,其分别有58%、55%和60%缺乏内含子(Li et al.,2022;Barvkar et al.,2022) 利用實时荧光定量PCR对7个FvUFGT基因在森林草莓各组织中的表达处境举行检测,察觉FvUFGT基因在不同组织中有不同的表达,说明不同基因在不同部位发挥作用。

      FvUFGT94基因在森林红果和森林白果2种不同类型的果实中的表达量无显著差异,在各组织中有较高表达,可能参与草莓的整个生长发育过程;FvUFGT67和FvUFGT68基因在根中有较高表达,揣测该基因会影响森林草莓根的生长发育;FvUFGT95和FvUFGT96基因在果实中有较高表达水平,揣测其影响森林草莓果实生长FvUFGT基因不仅在森林草莓果实中表达,在其他组织也均有表达,且表达量较高,揣测FvUFGT基因除了在果实中参与花色苷合成,还可能在其他组织中参与类黄酮糖基化在其他类似研究中,日本牵牛花UFGT基因不仅参与花色苷的合成,对花色素的糖基化和酰基化也起作用(Morita et al.,2022);矮牵牛中的UFT79B31基因可调控花粉的类黄酮糖基化(Knoch et al.,2022);草莓中UGT71K3也会影响葡萄糖酰基间苯三酚的含量(Song et al.,2022)本研究通过对FvUFGT基因在果实不同发育期的表达分析,察觉FvUFGT33和FvUFGT95基因在森林草莓红果成熟期表达水平极高,而在森林草莓白果成熟期表达量低,揣测这2个基因在花色苷合成中发挥作用这与大量研究结果类似,如在红色和白色葡萄相关研究中察觉,UFGT基因在红色品种中表达,而在白色品种中不表达(Kobayashi et al.,2022;王军和于淼,2022;Sun et al.,2022);刺葡萄转录组分析察觉,UFGT基因在黑果刺葡萄中有较高表达,而在白果刺葡萄中不表达。

      4 结论 7个FvUFGT基因表现出明显的组织差异性,其中FvUFGT33和FvUFGT95基因在果实中有较高表达量,且在森林草莓红果类型表达量显著高于白果类型,故揣测其在花色苷合成中发挥作用 — 4 —。

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