PubMed使用指南.ppt

医学文献资源检索与利用PubMed数据库检索中山大学医学文献检索教研室朱伟丽 zhuweili@020-87330445 2011年5月Outline数据数据库概况概况数据数据库检索索检索索结果果处理理ＭＭyNCBIyNCBI1、PubMed------概况-纸质版（Index Medicus,IM美国医学索引）-----光盘版（MEDLARS on Line ,MEDLINE）------网络版(PubMed)，收录时间范围：1947-，部分期刊回溯至创刊年数据每日更新(Tuesday –– Saturday)-世界上权威性的生物医学生物医学书目目型数据库，收录全世界范围内70多个国家和地区近5000种生物医学相关期刊期刊论文文，主要收录英语语种期刊，少部分其他语种期刊 学科范围涵盖基础医学、临床医学、护理学、口腔医学、兽医学、营养卫生、药理和药剂学、预防医学、卫生管理、医疗保健和情报科学领域，2000年起新增生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学领域- 全球免免费使用，部分文献免费获取全文- 集成在NCBI平台，访问网址(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed)1 PubMed------概况记录组成- OldMEDLINE[PubMed - OLDMEDLINE ] ：1947-1965年间的MEDLINE数据，正在做回溯加工，补充主题词及部分全文链接- MEDLINE[PubMed-indexed for MEDLINE]：标引了主题词被MEDLINE正式收录的文献数据。

PreMEDLINE [PubMed-in process]：已被MEDLINE录用，正处于加工标引状态的文献数据 [Epub ahead of print ][PubMed-as supplied by publisher]：由出版商提供的纸质版尚未正式出版的文献，大部分最终会转入PubMed-in process，再正式转入MEDLINE，部分不在MEDLINE收录学科范围内的数据，最终会转化为PubMed-as supplied by publisher/PubMed 状态 Publisher-Supplied [PubMed-as supplied by publisher/PubMed]：由出版商提供但因其学科不在MEDLINE收录学科范围内，而最终未进入MEDLINE但保留在PubMed中的文献数据OLDMEDLINEMEDLINEPreMEDLINE[Epub ahead of print ]supplied by publisherPubMed/supplied by publisher未入选数据PubMed标引主题词入选数据PubMED形成示意图检索区检索区2PubMed------检索- 基本检索- Limit限定检索- MeSH词检索（主题检索）- 检索史组配检索- Clinical Queries（临床咨询模块）- Single Citation Matcher（单篇引文匹配）①PubMed基本检索- 支持布尔逻辑运算 AND, OR, NOT-支持截词检索*-支持字段检索：如liver cancer[ti]- 支持短语检索 “ ”-自动词语匹配(字段限定、词组、截词检索时该功能失效)案例1(自动词语匹配）请利用PubMed检索有关结肠造口术后患者的护理的相关文献。

检索词： 结肠造口术---------colostomy 护理-------nursingcolostomy nursing自动词语匹配: PubMed对检索用户输入的检索词,如果不限定检索字段,系统依次到MeSH转换表、刊名转换表、作者全名转换表、作者索引表、合作者全名转换表、合作者转换表进行词语的核对、转换和检索，如果在上述六个表中都找不到匹配的短语，系统将短语拆开，继续到这六个表中搜索，短语断开部分为AND关系如果拆到的单词在上述五个表中还是找不到匹配词，将到所有字段中去搜索这些单词，单词之间的逻辑关系也是AND 案例2（截词检索） 请利用PubMed检索有关肝移植患者术后生活质量的相关文献 检索词： 肝移植---------liver transplant* 生活质量-------quality of lifeliver transplant* quality of life案例3（精确检索） 利用PubMed检索有关胎儿染色体异常的产前诊断研究 产前诊断： Prenatal Diagnosis 胎儿染色体异常：Fetal Chromosomal Abnormalities“Prenatal Diagnosis” “Fetal Chromosomal Abnormalities”案例4（字段检索）检索cell杂志上发表的有关干细胞移植方面的文献检索词：stem cell transplant* cell[ta]常用字段：ti(题名）、 tiab（题名或摘要）、 au（作者）、 1au(第一作者）、lastau(最后一位作者）、ta（刊名）、ad(地址）、all（所有字段）、majr(主要主题词）、mh（主题词)……②PubMed限定检索功能：a 字段限定 b 时间限定 c 文献类型限定 d 语种限定 e 年龄性别限定 f 全文获取限定 g 检索子集限定 ……案例1 作者与文献语种限定 检索2002年以来PubMed收录的葛坚教授发表的青光眼的中文文献。

检索词： 作者：ge jian[2002年以后的作者年以后的作者检索可以用全称索可以用全称] 主题概念：glaucoma Limits：2002-2010 出版年限 Chinese 语种限定 作者检索tipsw作者输入格式:姓前名后,姓用全称,名字用首字母,姓与名之间不加标点符号如Michael R, Nash --------- Nash MRw自动转换作者名检索:输入Smith j[au] 将检索出Smith ja,Smith jb,Smith jr等w作者精确检索:“ ”将作者名引起来,再加[au] 如输入“smith j”[au]则仅检索出姓为Smith,名首字母为j的作者的文献.ge jian glaucoma案例2 文献时间与类型限定 利用PubMed检索近十年来干扰素β治疗多发性硬化症的综述文献 干扰素β——interferon beta 多发性硬化症——multiple sclerosis 限定：last 10 years Revieww检索肝移植患者术后生活质量的研究，要求检索词出现在篇名中，检索结果可以获取全文。

检索词：liver transplantation、quality of life 检索字段： 篇名 限定：link to full text案例3 全文获取限定Liver transplantation quality of life案例4 文献子集限定护理类杂志上发表的有关循证护理研究的文献 检索词：evidence based nursing 检索字段： MeSH 限定：subset-----nursing journals③PubMed-----主题词检索 üPubMed依据MeSH词表（医学主题词表）对所收录数据进行主题标引ü利用主题词检索可以提高文献检索效率üMeSH网络版本集成在PubMed数据库中案例 检索有关结肠造口 (colostomy)患者的护理（nursing)的文献colostomy 主题词注释 可组配的副主题词 主题词加权与扩展入口词 主题词树主要主题词限定检索(加权检索) 检索近十年以来PubMed收录的甘精胰岛素治疗2型糖尿病的临床研究文献。

检索词： 甘精胰岛素： insulin glargine 2型糖尿病：type 2 diabetes mellitus ④④PubMed-----检索史组配检索检索史组配检索同义词如2型糖尿病wnon insulin dependent diabetes mellituswNIDDMwType 2 Diabetes （Mellitus ）wAdult-Onset Diabetes Mellitus wMaturity-Onset Diabetes Mellitus wStable Diabetes Mellitus wSlow-Onset Diabetes Mellitus wKetosis resistant diabetes⑤. PubMed------Clinical Queries 为帮助临床医生更有效地获取PubMed数据库中一般疾病的病因学、预后、诊断、治疗及预防等方面的信息，PubMed设置了Clinical Queries功能 该功能具备特殊的过滤器装置能将上述主题文献集中提供检索⑥. PubMed------Single Citation Matcher功能功能:输入题录信息，查找特定文献，参考文献补缺。

注意:w刊名要准确，缩写要标准w作者字段第一作者与最后一名作者需用简写Example:查找： smithies oliver 发表在blood第12期上关Hematopoietic stem cells的文献的篇名、其他作者、页码等信息3 PubMed------检索结果处理w检索结果显示w检索输出、保存w全文链接：LinkoutSummary：默认格式，包括作者、篇名、出处、相关文献链接Summary (text)：summary的文本形式Abstract：篇名、作者、摘要、出处、主题词、全文链接标记等Abstract（text）： 篇名，作者，摘要，出处MEDLINE：所有记录字段XML格式、PMID list可通过Display下拉菜单选择其它显示方式七种检索结果显示格式①检索结果显示②检索结果输出、保存剪贴板:Clipboard(临时保存）注意:wClipboard(剪贴板)最多只能保存500条w最多可以保存8小时w长期保存,应存到myNCBI的collection中③全文链接----LinkOut4、 PubMed------MyNCBIw永久保存检索结果w保存检索策略，追课题发展w个性化设置①永久保存检索结果注册登录注册登录检索数据库PubMed最近的操作保存的文献保存的检索策略保存在collectionDM中的全部记录②保存检索策略为检索策略命名选择邮件发送频率、文献格式及接收文献最大数目编辑保存的策略点击执行检索重新执行已保存的策略修改已保存的策略③个性化设置更改高亮显示颜色PubMed小结w权威的生物医学二次文献数据威的生物医学二次文献数据库w便利的全文便利的全文链接接w即即时的文献的文献线索索w多多样化的化的检索途径索途径w准确、全面的准确、全面的检索效率索效率w个性化个性化检索服索服务。