
最全面fragstats4.2基本教程.docx
9页Fragstats 4.2 简易教程一、使用说明1.数据格式Fragstats能够支持多种数据格式,但 4.2 以及后续版本将使用 Geo TIFF grid作为主要的数据格式(图 1);图 12. 数据命名以及存放路径导入数据的名称和路径不能包含汉字和空格,且存放于二级目录,例如:D:\123\1987.tif3. 背景问题背景值默认设置为 999,但你完全可以在懂得其意义的前提下依照自己喜好 进行调整;简洁来说, 背景即你分析过程中想要自动忽视的某种地表类型——由于资料缺乏而无法归类、 或者你单纯想将其作为背景值处理的地表类型; 值得留意的是,当设定为正值时, 背景像元值被视作目标景观内部值; 当设定为负值时, 背景像元被视作目标景观外部值; 内部背景作为目标景观的一部分不仅会为整个景观面积作出贡献, 并且会因此而转变许多指数值; 外部背景不会被视作目标景观的一部分, 只会对影像边缘的连接性产生影响; 在景观运算中, 需要留意背景的影响;这是景观指数误差中很大的一部分; 比如说,我们拿到的遥感图像,校正好后,边界裁剪后,一般不是规章的矩形; 在边边角角存在没有信息的像元;图像分类后,没有信息的像元也是作为分类的一种的; 因此,需要对其进行去除;这个操作可以在 Arcgis 下操作;4. 下载地址http://www.umass.edu/landeco/research/fragstats/downloads/fragstats_d ownloads.html二、操作步骤2.1 打开 Fragstats第一,从开头菜单或双击桌面图标打开 Fragstats ;假如你的电脑上已安装10.0 及以下版本的 ArcGIS ,那么 Fragstats 打开时将有明显推迟(有时长达 30s),这是由于 Fragstats 在验证 ArcGIS 的使用许可( license );请务必保持耐心(图 2);图 22.2 新建模型接下来你需要创建一个 Fragstats 模型用于对斑块的景观结构进行分析; 一个 Fragstats 模型简洁来说就是为 Fragstats 进行了全副参数化, 即为其配备了分析所需的全部参数; 点击工具条上的 New按钮或从 File 的下拉菜单中选择 New 选项,即可创建一个空白模型(图 3);图 32.3 导入数据接下来需要输入一个数据进行分析;具体操作为:点击 Add a layer,打开如下(图 4)输入数据对话框;导入数据后软件会从其头文件中自动读取行列数及栅格大小,之后这些参数在对话框中就会变为灰色,无法更换;唯独可以更换、也需要多加留意的是背景值;图 4说明: Row/column count :行 / 列值计数, Background value :背景值, Cell size :输入像元长度(米) , Band :选取分析波段,用于多波段数据源2.4 设置分析参数点击用户界面左侧选框的 Analysis Parameters按钮;在这里你可以选择使用4 邻域或 8 邻域的邻域法就, 本教程接受默认的 8 邻域法及 No sampling〔不采样 〕设置;在 No Sampling 选项下勾选 Patch, Class, Landscape三种指数;请留意三种指数至少勾选其一, 同时留意只需勾选你想要运算的指数类型即可, 多勾选或者不勾选,软件将会报错;此外,在 No sampling 下面仍有一个生成斑块 ID 号的附加选框( GeneratePatch ID File);假如勾选这一选框, Fragstats就会为每一个栅格支配一个 ID 号;即 1 号斑块内的全部栅格的 ID 值都为 1, 2 号斑块内的全部栅格的 ID 值都为 2,以此类推;必需勾选相关选项,最终运行时才会进行运算图 52.5 景观指数选择指数一共有三个级别, path 、class 、landscape ;不同级别对应不同的指数, 对应着不同的生态学意义; 所以选择指数的时候, 确定要清楚所选择的指数对应的级别;第一,在用户界面的右上方选框内勾选斑块级别的景观指数; 点击 Patchmetrics 并勾选不同指标下的景观指数;你可以依据需要选择某些指数,或者直接选择 “selecat ll ”亦可;留意:假如在集合度( Aggregation)指标下选择了邻近系数( proximity index )或相像系数 〔similarity index〕, 那么你仍需要为其指定搜寻半径—— 运算这两个指标需要搜寻半径; 运算相像系数仍需要指定相像性权重表(见图 6);点击 [ ]可以指定需要的搜寻半径,如: 1000.00;图 6接下来, 点击 Class metrics可以选择类型级别下不同指标内的景观指数; 与上述方法相同,你可以依据需要选择某些指数,或者直接选择 “select al亦l可”;留意,在面积 -边缘( Area-Edge)指标下,假如你勾选了总边缘长度 〔Total Edge〕或边缘密度 〔Edge density〕这两个指数, 那么你需要对如何处理每种背景或边界细 加考虑;缺省情形下, 背景不作为真实边缘, 但你也可以选择把全部背景都作为边缘,或把某部分背景作为边缘;点击 [ ]即可对缺省值进行修改;留意:由于(本文)输入的景观自带包界,且不包含任何背景,因此这个问题不会显现;同样的,假如在集合度指标 (Aggregation)下勾选了连通系数 (connectance index),那么你仍需要对什么是 “连通”设定一个阈值;点击[ ]即可设定阈值,单位为米, 如: 500;(见图 7)图 7最终,点击 Landscape metrics可以选择景观级别下不同指标内的景观指数;与上述方法相同, 你可以依据需要选择某些指数, 或者直接选择 “select all亦可”;留意:在多样性指标下假如选择了相对拼块多度 〔Relative Path Richness),那么你仍需要给定最大地表分类数(或斑块类型数);点击 [ ]即可给定该值,例如本 例中设定为 6;(见图 8)图 82.6 储存模型接下来你可能需要将此设置好的模型进行储存,备作以后使用;一般来说对现有的文件进行修改会比从零开头设置要简洁得多; 记得在设置参数的过程中时不时地点击 Save 或 Save as 对模型进行储存;2.7 运行模型接下来要做的就是运行模型;直接点击 Run 按钮,或从“ Analysis ”的下拉菜单里就可以打开运行窗口;运行窗口里面包含分析类型(本例中选择的是 No sampling )以及斑块、 类型及景观各个级别内勾选的指数数目; 假如这些信息无误,那么点击 Proceed 按钮就可启动运行,否就点击 Cancel 再对模型设置进行调整;在本例中,一共有 75 个斑块级别指数、 109 个类型级别指数以及 116 个景观级别指数参与了运算,这是由于我全选了全部级别的指数(见图 9);图 92.8 查看结果留意到用户界面右下角的运行日志( Activity log );假如运算顺当,那么你可以在日志中看到运算停止时间,以及整体所用时间; 点击右上角的 Results 按钮就可以在斑块、 类型和景观级别下分别查看对应的景观格局指数(见图 10);2.9 储存结果图 10选择“ save run as ”就将表格储存为 fragstats 的专有格式(见图 11);*.patch :储存 patch 表格信息*.class :储存 class 表格信息*.land :储存 landscape 表格信息*.adj :储存数据源信息2.10 在 excel 中打开表格图 11在 excel 中选打开文件,文件类型选“全部文件” ;打开后进入导入数据向导窗口(见下图);10760 T30050. 406114510 639L36.306334615848 50006 981914513.63921 9959S7CN22 280M14 48948981 27141 2gP98]" o en822.5J0 A 4 895 iS4 i 379B 613’。
