Stata制作ORRR的95CI森林图,及横坐标X轴调整,如何产生长短不均坐标轴.docx

 Stata制作OR/RR的95%CI森林图，及横坐标X轴调整，如何产生长短不均坐标轴最近在做危险因素OR的森林图，stata效果较好但也遇到问题，如一些文献中横坐标X轴坐标尺不一样，如何调整，论坛里一直每一找到这方面太多的解释，但在公卫人里面的peking_sky里面提到了这个问题的解决方法坛里有朋友说是对数转换，是正解呀，但没有给出步骤我就来个抛砖引玉吧，跟大家一起学习Stata 做森林图，一个采用命令metan；一是用鼠标，即User---Meta-analysis下面的选项、一、数据步：1. 数据中输入4个变量分别为factor OR CI1 CI2 (分别代表OR值，CI下限、CI上限)，并输入数值2.产生新变量，对数据进行对数转换程序：gene lnor=ln(OR)gene lnci1=ln(CI1)gene lnci2=ln(CI2)二、作图步：3.作图，我们看到的横坐标标尺不一样，即是使用了对数转换，使用eform这个命令：Metan lnor lnci1 lnci2, eform label(namevar=factor)4.我们常常在X轴上要添加坐标数值，常常0.5,1.0,10也要写上，用xlabel语句，如xlabel(0.5,1.0,10)，数值可随意增加和修改，用逗号分开即可；X轴的坐标尺采用xtick命令，xtick只显示坐标轴下面的小线条即坐标尺，不出现数值，如xtick(2,3,4,5,6,7,8,9)。

5.我们如果是做危险因素OR的森林图，那我们常常不需要最后一行stata直接给出的overall，那就用nooverall，即overall那一行的OR不出现；不需要出现最右边加权项的值，则用noowt；图中的OR点上有时候去会看到灰色的大方块，这个灰色方块表示权重的大小，常常不好看，若不需要显示则用nobox好，那综合这个功能，做OR的森林图程序就是metan lnor lnci1 lnci2,eform lable(namevar=factor) xlable(o.5,1.0,10) xtick(2,3,4,5,6,7,8,9) nowt nooverall nobox 若作图了，我们可以看到横坐标的标尺是不均衡的，这是由于上面采用了对数转换的关系但是，我们现在一般是采用鼠标点击User—Meta-analysis—of binary and continuous—进行操作在鼠标操作用，若要横坐标标尺不一致，使用的数据必须对数ln转换（用excel或者前面的gene命令语句），同时在effect选上Exponentiate这是采用了横坐标对数转换的图即使用ln数据，和选上Effect中的Exponentiate的结果）对比一下，如果我们采用原始数据OR，CI1，CI2作图的话，同时不勾选Exponentiate（下面这个图的横坐标标尺是一致的、等距的）这两个森林图相比，可能第一个比较方便，尤其是有OR的CI比较接近且小时候，第二个等间距坐标较难看，而且近似一个点。

当然第二个森林图的标记线在X=0处，这是我们不需要的；我们需要的是X=1出，即在Graph Opts增加一个null(1)即可；若不写，此处默认是null(0)，即X=0处好了，对比这几张森林图，我想，关于横坐标转换，标尺不一致的问题大家应该了解了，核心就是对原始数据对数转换，写程序的话，加上eform语句；若使用鼠标，也选对数的数据，同时选上effect中的exp选项当然，后续的图表编辑，修改Study id和变量、调整位置等，都是鼠标单击双击点选的问题了，比较繁杂以后有机会再一块探讨吧~。