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DNA甲基化测序服务DNA甲基化是表观遗传学(Epigen.docx

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  • 卖家[上传人]:鲁**
  • 文档编号:517188964
  • 上传时间:2023-05-15
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    • DNA甲甲基化测测序服务务 DNAA甲基化化是表观观遗传学学(Eppigeenetticss)的重重要组成成部分,在在维持正正常细胞胞功能、遗遗传印记记、胚胎胎发育以以及人类类肿瘤发发生中起起着重要要的作用用,是目目前新的的研究热热点之一一在哺哺乳动物物中,甲甲基化一一般发生生在CppG的胞胞嘧啶55位碳原原子上,通通过使用用5’-甲甲基胞嘧嘧啶抗体体富集高高甲基化化的DNNA片段段,并结结合Illlumminaa高通量量测序平平台,对对所有富富集的DDNA片片段进行行高通量量测序,研研究人员员能够获获得全基基因组范范围内高高精度的的甲基化化状态,为为深入的的表观遗遗传调控控分析提提供了更更有利的的切入点点DNA甲甲基化测测序技术术优势Ø 灵活度高高:能够够直接对对任意物物种的高高甲基化化片段进进行测序序,无需需已知的的基因组组序列信信息Ø 检测范围围广:覆覆盖整个个基因组组范围的的甲基化化区域Ø 精确度高高:能够够在实际际结合位位点500个碱基基范围内内精确定定位Ø 数字化信信号:直直接对甲甲基化片片段进行行测序和和定量,不不存在传传统芯片片杂交的的荧光模模拟信号号带来的的交叉反反应和背背景噪音音问题。

      图1MeeDIPP-Seeq测序序技术能能够覆盖盖整个基基因组区区域包括括启动子子区、内内含子、外外显子、基基因间,甚甚至是一一些重复复序列,并并能分析析这些区区域各自自的甲基基化程度度,右上上角的不不同颜色色就代表表了不同同的甲基基化程度度(摘自自Dowwn TTA.,, ett all, 220088, NNatuure Biootecchnoologgy)康成生物物提供的的DNAA甲基化化测序服服务流程程:1. 甲基化DDNA免免疫共沉沉淀(MMeDIIP)2. 测序文库库构建Ø 双链DNNA末端端修复及及3’末端端加’AA’Ø 使用特定定的测序序接头连连接DNNA片段段两端Ø 高保真聚聚合酶扩扩增构建建的测序序文库3. DNA成成簇(CClussterr)扩增增4. 高通量测测序(IIlluuminna GGenoome Anaalyzzer IIxx)5. 数据分析析Ø 原始数据据读取Ø 与数据库库比对并并进行注注释Ø 确定甲基基化位点点Ø 深层次数数据分析析6. 提供实验验报告Ø 原始数据据报告(FFastta-格式),包包含所有有测序序序列信息息,碱基基读取质质量评估估Ø 基本数据据分析报报告(EExceel表格格),包包含有效效序列的的序列信信息、与与参考基基因组比比对后的的注释信信息等。

      Ø 高级数据据分析(应应客户要要求定制制),如如甲基化化区域(eenriicheed rregiion)鉴鉴定,分分析两样样本间甲甲基化水水平有差差异的区区域并注注释,结结合表达达谱分析析其对基基因的表表达调控控。

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