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牛亚科是一个庞大的分类学集群，其现存的物种有十五种之多家牛属包括欧 洲普通牛（Bos taurus）和瘤牛(Bos indicus)两个牛种牛亚科中与家牛属中的普通牛和瘤牛有过基因交流的牛种有牦 牛（Bos grunniens），斑腾牛（Bos banteng），牜曷 牛( Bos gaurus)研究背景•欧洲牛起源于土耳其的安纳拖利亚•科学家已经证实瘤牛起源于印度，•斑腾牛起源于印度尼西亚的爪哇牛，•牦牛起源于中国青藏高原•中国与现代牛起源的国家—土耳其、印 度与印度尼西亚等国家直接或间接相连 ，是研究早期现代黄牛起源与迁徙的一 个关键地区中国黄牛起源复杂中国黄牛起源复杂目前，对于中国黄牛的起源一直存在着目前，对于中国黄牛的起源一直存在着多元起源的不同观点究竟起源于哪几个多元起源的不同观点究竟起源于哪几个牛种，观点不一因此，中国黄牛的起源牛种，观点不一因此，中国黄牛的起源进化与遗传多样性评价仍然一直是人们感进化与遗传多样性评价仍然一直是人们感兴趣的研究课题之一兴趣的研究课题之一时手观点1通过对中国黄牛Y染色体研究，认为北方黄牛受普通牛的影响大，南方黄牛受瘤牛的影响大，中原黄牛同时受普通牛和瘤牛的影响。

观点2中国黄牛起源于普通牛、瘤牛和牦牛，云南可能是中国瘤牛的起源地之一观点3中国黄牛起源于普通牛、印度瘤牛、斑腾牛、印度野牛和非洲瘤牛，海南可能是中国瘤牛的起源地之一1.1 实验动物：18个牛品种：1. 哈萨克牛, 2. 早胜牛, 3. 延边牛, 4. 蒙古牛, 5. 渤海黑牛, 6. 晋南牛, 7. 鲁西牛, 8. 秦川牛, 9. 郏县红牛, 10. 西镇牛, 11. 南阳牛, 12. 宣汉牛, 13. 威宁牛, 14. 黎平牛, 15. 吉安牛, 16. 闽南牛, 17. 雷州牛, 18. 海南牛，共136头个体 1.线粒体Cyt b基因全序列多态性分析图 1 本研究所选牛品种在中国的地理分布 1. 哈萨克牛, 2. 早胜牛, 3. 延边牛, 4. 蒙古牛, 5. 渤海黑牛, 6. 晋南牛, 7. 鲁西牛, 8. 秦川牛, 9. 郏 县红牛, 10. 西镇牛, 11. 南阳牛, 12. 宣汉牛, 13. 威宁牛, 14. 黎平牛, 15. 吉安牛, 16. 闽南牛, 17. 雷州牛, 18. 海南牛图中的粗体线条代表秦岭表 4 不同牛种群间(对角线以上)和种群内(沿角线)的Kimura 2-parameter遗传距离 Groups 类类型Northern Group北方牛Zhongyuan Group中原牛Southern Group 南方牛Northern Group 北方牛0.00550±0.000880.01002±0.001930.01271±0.00262Zhongyuan Group 中原牛0.00955±0.001900.00891±0.00178Southern Group 南方牛0.00655±0.00128表 4 不同牛种群间(对角线以上)和种群内(沿角线)的遗传距离 1.3.41.3.4 中国黄牛三大类型遗传关系分析从表4可以看出，北方黄牛种群和南方黄牛种群内品种间表现出相对较低的遗传分化；而中原黄牛种群内的品种间则具有相较高的遗传分化，中原地区牛种群和南方黄牛种群之间的遗传距离相对较小，这是由于中原地区牛种群中相对多数的黄牛个体是瘤牛起源。

n从母系说明中国黄牛主要起源于瘤牛和普通牛；n几乎所有的北方黄牛和普通牛聚在一起，大部分南方黄牛和瘤牛聚类，说明北方黄牛受普通牛的影响较大，南方黄牛受瘤牛的影响较大n中国黄牛和斑腾牛、羯牛、牦牛的亲缘关系非常远1.41.4 讨论与小结讨论与小结n北方黄牛和南方黄牛之间存在着显著的遗传分化，这主要与秦岭的地理隔离作用和气候环境的差异有直接的关系n中原地区黄牛受普通牛和瘤牛影响力大小因品种而异，普通牛对于秦川牛、晋南牛和渤海黑牛的影响相对瘤牛要大，而瘤牛对鲁西牛、郏县红牛和南阳牛的影响相对普通牛要大1 本研究发现中国黄牛存在明显的地理 结构， 北方黄牛主要起源于普通牛 ，中原黄牛和南方黄牛同时受到普通 牛和瘤牛的影响2 本研究发现中国黄牛中普通牛类型的 遗传多样性丰富，而瘤牛类型的遗传 多样性贫乏 3 支持云贵高原可能是中国瘤牛的起 源地，不支持海南是中国瘤牛起源地 的观点 小结父系微卫星标记分析：表1 Y染色体上的 11个微卫星位点的资料信息 位点 Loci引物序列 Primer Sequences（5’­­3’ ）退火温度（℃） Annealing temperature重复序列类型 Type of repeatINRA124F：GATCTTTGCAACTGGTTTG R：CAGGACACAGGTCTGACAATG55(GT)4A(TG)9UMN3008F：TTGTGGAGGACTATTCATGG R：TCTGGACTCGACAGGACACC56（TG）17UMN3007F：GATACAGCTGAGTGACTAAC R：GTGCAGACATCTGAGCTGTG58（CA）18UMN1203F：AACCAGTTGCGCACTCACCA58（CA）13UMN0920F：GTTGAGGACTCTTGCATCTG R：CACAGGCCTAGAAGATTGAG61(TG)11~12UMN2303F： TACTTGCTTGAGACTTACTG R：TGTGAACACATCTGATTCTG56(TG)17UMN0103F：ACACAGAGTATTCACCTGAG R：ATTTACCTGGGTCAAAGCAC60(CA)22UMN2404F： F：GGTACAATTGAAAATATG R：TGTACCTACACTGATATGTT54(CA)18Nn10(TA)8UMNO504F： F：AGGCCATCTGCATAGTGAAG R：TGCTGGACTGCTCATCTCTG56(CT)3GT(CT)3(GT)2BMS861F ：TTGAGCCACCTGGAAAGC R：CAAGCGGTTGGTTCAGATG56(GT)6C(TG)10表2 INRA124位点在14个黄牛品种瘤牛型和普通牛型等位基因频率分布群体 Groups品种 Breeds个 体 数Y等位基因类类型个体数数 Number of Y alleleY染色体等位基因频频率 Frequencies(%) of Y allele 瘤牛型Indicine普通牛型Taurine瘤牛型 Indicine普通牛型 aurine 北方牛 Northern哈萨萨克牛1831516.783.3 早胜胜牛292276.993.1 蒙古牛7070100 延边边牛220220100 总总数765716.693.4 中原牛 Central Area秦川牛31102132.367.7 晋南牛135838.561.5 南阳牛28181064.335.7 鲁鲁西牛191901000 总总数91523957.142.9 南方牛 Southern宣汉汉牛1312192.37.7 思南牛1713476.523.5 皖南牛323201000 吉安牛9901000 闵闵南牛222201000 雷州牛212101000 总总数114109595.64.4 总总数 28116611559.140.9。