
核苷酸与核酸课件.ppt
41页重点内容重点内容核苷酸与核酸核苷酸与核酸 Nucleotides and Nucleic Acids核苷酸与核酸课件核酸通论核酸通论脱氧核糖核酸(脱氧核糖核酸(DNA))核糖核酸(核糖核酸(RNA))核酸(核酸(nucleic acid))核苷酸与核酸课件核核 酸(酸(nucleic acid))核苷酸(核苷酸(nucleotide)) 磷酸(磷酸(phosphoric acid))核苷(核苷(nucleoside))戊糖(戊糖(pentose))碱基(碱基(base))一、核酸的组成一、核酸的组成核酸的结构核酸的结构或核糖或核糖核苷酸与核酸课件核苷酸与核酸课件核酸的结构核酸的结构Ø 核糖与碱基之间通过核糖与碱基之间通过N-( -)糖苷键相连,形成糖苷键相连,形成核苷;核苷;Ø 核苷中的戊糖羟基被磷酸酯化,形成核苷酸,核苷中的戊糖羟基被磷酸酯化,形成核苷酸,核苷与磷酸之间主要通过核苷与磷酸之间主要通过5’-磷酸酯键相连磷酸酯键相连核苷酸与核酸课件核酸的结构核酸的结构嘧啶核苷嘧啶核苷嘌呤核苷嘌呤核苷1’1’2’2’3’3’4’4’5’5’(OH)1’1’2’2’3’3’4’4’5’5’(OH)核苷酸与核酸课件二、核酸的共价结构二、核酸的共价结构•核核酸酸((DNA与与RNA))是是核核苷苷酸酸聚聚合合成成的的生生物物大大分分子子,,无分支结构。
无分支结构•核核酸酸的的共共价价结结构构就就是是核核酸酸的的一一级级结结构构,,通通常常指指核核酸酸的的核苷酸序列核苷酸序列核酸的结构核酸的结构核苷酸与核酸课件•DNA与与RNA均以均以3',5'-3',5'-磷酸二酯键磷酸二酯键连接核苷酸连接核苷酸核酸的结构核酸的结构核苷酸与核酸课件三、三、DNA的三维空间结构的三维空间结构•二二级级结结构构::DNA的的两两条条多多聚聚核核苷苷酸酸链链间间通通过过氢氢键键形形成成的双螺旋(的双螺旋(double helix)结构•三级结构:三级结构:DNA双链进一步折叠卷曲形成的构象双链进一步折叠卷曲形成的构象•四级结构:四级结构:DNA与蛋白质的复合体结构与蛋白质的复合体结构核酸的结构核酸的结构核苷酸与核酸课件(一)(一)DNA的二级结构的二级结构核酸的结构核酸的结构1953年,年,Watson和和Crick根据根据Chargaff 规律和规律和DNA钠盐纤维的钠盐纤维的X光衍射光衍射结果提出了结果提出了DNA的双螺的双螺旋结构模型旋结构模型核苷酸与核酸课件Watson-Crick双螺旋结构模型双螺旋结构模型核酸的结构核酸的结构Ø 两条反向平行(一条两条反向平行(一条5’→3’,另一条,另一条3’→5’)的多核)的多核苷酸链绕同一中心轴相互缠绕,形成右手双股螺旋。
苷酸链绕同一中心轴相互缠绕,形成右手双股螺旋核苷酸与核酸课件核酸的结构核酸的结构Ø碱碱基基位位于于双双螺螺旋旋的的内内侧侧,,磷磷酸酸与与脱脱氧氧核核糖糖在在双双螺螺旋旋外外侧侧,,构构成成DNA分分子子的的骨骨架架;;外外部亲水,内部疏水部亲水,内部疏水核苷酸与核酸课件核酸的结构核酸的结构Ø碱碱基基平平面面接接近近与与纵纵轴轴垂垂直直,,糖糖环环的的平平面面接接近近与与纵纵轴轴平行核苷酸与核酸课件核酸的结构核酸的结构Ø 双螺旋是一种双螺旋是一种有规律的结构有规律的结构平均直径平均直径2 nm螺距螺距3.4 nm每旋转一周的核每旋转一周的核苷酸数目苷酸数目10碱基堆积距离碱基堆积距离0.34 nm相邻核苷酸夹角相邻核苷酸夹角36o2.0 nm核苷酸与核酸课件核酸的结构核酸的结构Ø 大沟与小沟大沟与小沟核苷酸与核酸课件核酸的结构核酸的结构Ø 两条链依靠碱基之间形成的氢键结合在一起两条链依靠碱基之间形成的氢键结合在一起碱基配对碱基配对原则:原则:A--T G--C核苷酸与核酸课件稳定双螺旋结构的因素稳定双螺旋结构的因素①①碱基堆积力碱基堆积力((base-stacking interactions))疏水作用+范德华力疏水作用+范德华力②②碱基配对的氢键。
碱基配对的氢键GC含量越多,双螺旋越稳定含量越多,双螺旋越稳定核酸的结构核酸的结构核苷酸与核酸课件核酸的结构核酸的结构l 碱基在一条链上的排碱基在一条链上的排列顺序不受任何影响;列顺序不受任何影响;但是根据碱基配对原则,但是根据碱基配对原则,当一条链的序列被确定当一条链的序列被确定后,即可决定另一条互后,即可决定另一条互补链的序列补链的序列核苷酸与核酸课件(二)二)DNA的三级结构的三级结构•DNA在双螺旋的基础上通过扭曲和折叠形成的构象在双螺旋的基础上通过扭曲和折叠形成的构象•包括不同二级结构单元间的相互作用、单链与二级结构单包括不同二级结构单元间的相互作用、单链与二级结构单元间的相互作用以及元间的相互作用以及DNA的拓扑特征的拓扑特征•超螺旋(超螺旋(supercoil)是)是DNA三级结构的主要形式三级结构的主要形式核酸的结构核酸的结构核苷酸与核酸课件核酸的结构核酸的结构超螺旋的功能超螺旋的功能Ø超螺旋有助于超螺旋有助于DNA在细胞内的包装;在细胞内的包装;Ø负超螺旋易于解链,有利于负超螺旋易于解链,有利于DNA的复制、重组和转录的复制、重组和转录等过程的进行;等过程的进行;Ø生物体内可通过调节生物体内可通过调节DNA的拓扑结构来调节其功能。
的拓扑结构来调节其功能核苷酸与核酸课件(三)(三)DNA与蛋白质复合物的结构(四级结构)与蛋白质复合物的结构(四级结构)核酸的结构核酸的结构病毒:病毒:类型多样(环状双链、线型双链、线型单链、环状单链)类型多样(环状双链、线型双链、线型单链、环状单链)原核:原核:环状双链分子,集中于核区,包括染色体环状双链分子,集中于核区,包括染色体DNA与质粒与质粒DNA真核真核::细胞核细胞核DNA-线型双链分子,与组蛋白等形成-线型双链分子,与组蛋白等形成染色体染色体((chromosome)) 细胞器细胞器DNA-环状双链分子,一般裸露-环状双链分子,一般裸露核苷酸与核酸课件 染色体染色体DNA组装不同层次的结构组装不同层次的结构核酸的结构核酸的结构核苷酸与核酸课件核酸的结构核酸的结构四、四、RNA的结构的结构l RNA通常是单链线型分子通常是单链线型分子l RNA可自身回折形成局部双螺旋(二级结构),并进一可自身回折形成局部双螺旋(二级结构),并进一步折叠形成三级结构步折叠形成三级结构l RNA可与蛋白质形成核蛋白复合体(四级结构,例如核可与蛋白质形成核蛋白复合体(四级结构,例如核糖体)糖体)核苷酸与核酸课件tRNA的高级结构的高级结构 •三叶草形二级结构:茎+环三叶草形二级结构:茎+环•倒倒L形三级结构形三级结构 核酸的结构核酸的结构核苷酸与核酸课件核酸的结构核酸的结构l 维系维系tRNA三级结构的因素:氢键、碱基堆积力三级结构的因素:氢键、碱基堆积力l tRNA分子功能:转运氨基酸分子功能:转运氨基酸l tRNA分子具有与其功能相适应的柔韧性。
分子具有与其功能相适应的柔韧性核苷酸与核酸课件• 核酸的水解核酸的水解• 核酸的酸碱性质核酸的酸碱性质•核酸的紫外吸收核酸的紫外吸收•核酸的变性和复性核酸的变性和复性核酸的理化性质核酸的理化性质核苷酸与核酸课件一、核酸的水解一、核酸的水解•对酸的敏感性:糖苷键>磷酸酯键,脱氧核糖>核糖对酸的敏感性:糖苷键>磷酸酯键,脱氧核糖>核糖•RNA的磷酸酯键对碱敏感,的磷酸酯键对碱敏感,DNA抗碱水解(生理意义)抗碱水解(生理意义)•酶水解:酶的专一性;限制性内切酶(特点、应用)酶水解:酶的专一性;限制性内切酶(特点、应用)核酸的理化性质核酸的理化性质核苷酸与核酸课件二、核酸的酸碱性质二、核酸的酸碱性质•碱基、核苷与核苷酸均能发生解离碱基、核苷与核苷酸均能发生解离•核苷酸与核酸的磷酸基具有酸性,碱基具有碱性,因核苷酸与核酸的磷酸基具有酸性,碱基具有碱性,因此核苷酸与核酸具有两性解离的性质此核苷酸与核酸具有两性解离的性质•核苷酸与核酸中磷酸基的酸性大于碱基的碱性,其等核苷酸与核酸中磷酸基的酸性大于碱基的碱性,其等电点偏低(等电点的应用)电点偏低(等电点的应用)核酸的理化性质核酸的理化性质核苷酸与核酸课件三、核酸的紫外吸收三、核酸的紫外吸收核酸的理化性质核酸的理化性质l 嘌呤碱与嘧啶碱具有共轭双键,使碱基、核苷、核苷嘌呤碱与嘧啶碱具有共轭双键,使碱基、核苷、核苷酸和核酸在酸和核酸在240--290nm的紫外波段有强烈的光吸收的紫外波段有强烈的光吸收l λmax≈260nm核苷酸与核酸课件•紫外吸收光谱的应用紫外吸收光谱的应用Ø鉴定纯度鉴定纯度Ø核苷酸与核酸含量计算核苷酸与核酸含量计算Ø判断变性(判断变性(增色效应、减色效应增色效应、减色效应))核酸的理化性质核酸的理化性质在在DNA的变性过程中,的变性过程中, (P)值值增大(增色效应,增大(增色效应,hyperchromic effect))在在DNA的复性过程中,的复性过程中, (P)值值减小(减色效应,减小(减色效应,hypochromic effect))核苷酸与核酸课件四、核酸的变性、复性及杂交四、核酸的变性、复性及杂交核酸的理化性质核酸的理化性质( (一一) )变性(变性(denaturation))核酸双螺旋区的核酸双螺旋区的氢键氢键断裂,变成单链,不涉及断裂,变成单链,不涉及共价键共价键断裂。
断裂核苷酸与核酸课件•熔解温度(熔解温度(Tm):):ü加加热热变变性性使使DNA的的双双螺螺旋旋结构失去一半时的温度结构失去一半时的温度核酸的理化性质核酸的理化性质melting temperature•影响影响DNA的的Tm值的因素值的因素核苷酸与核酸课件( (二二) )复性复性核酸的理化性质核酸的理化性质•变性变性DNA在适当的条件下,两条彼此分开的单链可以在适当的条件下,两条彼此分开的单链可以重新缔合成为双螺旋结构,这一过程称为复性重新缔合成为双螺旋结构,这一过程称为复性•影响影响DNA复性的因素复性的因素ü降温速率,负效应(热变性的降温速率,负效应(热变性的DNA在缓慢冷却的条件在缓慢冷却的条件下可以复性,称为退火-下可以复性,称为退火-annealing))核苷酸与核酸课件( (三三) ) 分子杂交(分子杂交(hybridization))核酸的理化性质核酸的理化性质•在变性的在变性的DNA溶液中加入外源溶液中加入外源DNA单链分子或单链分子或RNA单链分子(与原单链分子(与原DNA具有序列互补性),去掉变性具有序列互补性),去掉变性条件后复性形成双螺旋结构的过程条件后复性形成双螺旋结构的过程。
核苷酸与核酸课件核酸的理化性质核酸的理化性质l分子杂交的种类分子杂交的种类ØSouthern Blotting:检测:检测DNAØNorthern Blotting:检测:检测RNA核苷酸与核酸课件核酸的研究方法核酸的研究方法l核酸的分离纯化和定量测定核酸的分离纯化和定量测定l核酸的离心分析核酸的离心分析l核酸的凝胶电泳核酸的凝胶电泳l核酸的测序核酸的测序lPCRlDNA的化学合成的化学合成核酸的研究方法核酸的研究方法核苷酸与核酸课件核酸的分离纯化核酸的分离纯化要点:要点:l利利用用各各种种核核酸酸的的特特性性选选择择合合适适的的纯纯化化方方法法((注注意意掌掌握原理);握原理);l抑制核酸酶的作用,防止核酸的降解和变性抑制核酸酶的作用,防止核酸的降解和变性核酸的研究方法核酸的研究方法核苷酸与核酸课件核酸含量的测定核酸含量的测定•紫外分光光度法紫外分光光度法核酸的研究方法核酸的研究方法A260=150 g/ml 双螺旋双螺旋DNA20 g/ml 寡核苷酸寡核苷酸40 g/ml 单链单链DNA/RNA核苷酸与核酸课件核酸的凝胶电泳核酸的凝胶电泳琼脂糖凝胶电泳分离核酸琼脂糖凝胶电泳分离核酸并测定并测定DNA分子量分子量核酸的研究方法核酸的研究方法核苷酸与核酸课件核酸测序核酸测序核酸的研究方法核酸的研究方法双脱氧终止法测定双脱氧终止法测定DNA序列序列核苷酸与核酸课件DNA聚合酶链反应(聚合酶链反应(PCR)) PCR:体外扩增:体外扩增DNA的技术的技术核酸的研究方法核酸的研究方法Ø必备条件必备条件Ø核心反应(原理)核心反应(原理)Ø核心技术核心技术Ø核心酶核心酶核苷酸与核酸课件。
