林木基因组与生物信息学.doc

1林木基因组与生物信息学博士学位研究生培养方案（090720）一、培养目标培养为社会主义现代化建设服务，德、智、体全面发展的相关领域高层次专门人才具体要求：1、较好地掌握马克思列宁主义、毛泽东思想的基本原理和邓小平理论、 “三个代表”的重要思想；树立辩证唯物主义和历史唯物主义世界观2、拥护党的基本路线，热爱祖国，遵纪守法，品行端正具有强烈的事业心和为科学事业献身的精神3、掌握本学科领域坚实宽广的基础理论和系统的专门知识，熟悉本学科领域国内外研究现状和前沿动态，具有独立进行科学研究、攀登本学科高峰和取得创造性新成果的能力4、熟练掌握一门外国语 5、具有健康的体魄和良好的心理素质二、二级学科及研究方向林木基因组与生物信息学本学科的研究方向：（1）林木基因组学：基因组学基本平台构建，基因组测序，序列拼接与组装技术，基因注释，基因组结构与特征分析，重要树种基因组的古多倍化事件，基因的复制与扩张，转录组及蛋白质组差异显示分析技术等2）林木功能与比较基因组学：重要基因资源的研发与功能分析，利用比较基因组手段研究基因组进化，阐明基因家族演化与生长发育、适应性及抗性形成的分子机制，基因组中基因表达调控非编码区序列的识别及功能分析。

3）生物信息学：应用先进的数据库管理技术、数学分析模型和计算机软件对各种生物信息进行提取、储存、处理和分析，研究复杂生命现象的形成模式与演化规律三、学习年限和时间安排博士生学习年限一般为 3 年，经本人申请、导师同意、学校批准，可延长学习年限，但一般不超过 6 年一般前半年至 1 年时间为课程学习阶段，后 2 年至 2 年半（及以上）时间主要从事科学研究和撰写学位论文2四、课程设置、学分和学时要求博士生课程按性质分为学位课和非学位课总学分最低为 15 学分（同等学力总学分最低为 18 学分） ，其中学位课程不少于 9 学分，余者为非学位课程20 学时对应 1 个学分博士生课程设置一览表课程类别 课程名称及学分 最低学分82005 中国马克思主义与当代 2 学分82004-1 英语（博） 2 学分公共学位课82004-11 英语阅读与写作（博） 1 学分5 学分12055 生物信息学专题 2 学分12050 功能基因组学专题 3 学分学位课专业学位课12047 蛋白质组学专题 3 学分4 学分83304 马克思主义经典著作选读 3 学分12053 群体与数量遗传学专题 3 学分12054 森林遗传改良原理专题 3 学分12052 进化遗传学专题 2 学分12048 发育遗传学专题 2 学分13463 生物物理学 2 学分12051 基因分析仪器应用专题 2 学分13490 生物统计学 2 学分13551 生物信息学 3 学分13583 遗传图谱和 QTL 定位统计分析 2 学分72014 C 语言 3 学分非学位课程选修课73327 MATLAB 语言 2 学分6 学分五、培养方式和方法研究生培养方式应灵活多样，应充分发挥导师指导研究生的主导作用，建立和完善有利于发挥学术群体作用的培养机制。

应强调在培养过程中发挥研究生的主动性和自觉性，更多地采用启发式、研讨式的教学方式，可规定研究生参加必要的学术讲座、学术报告、讨论班、社会实践和社会调查，注重研究生的自学能力、动手3能力、表达能力和写作能力训练和培养六、实践环节和学术活动博士生应辅助导师担任硕士生或本科生教学工作量 40 学时左右的教学实践（如讲部分章节课、、指导实验课程设计、指导毕业设计等） 没有实际工作经验的博士生应安排到有关企事业单位参加生产实践、社会调查、科研基地工作 1—2 周参加教学实践或生产实践（社会调查、科研基地工作）环节均须考核，但不计学分考核合格后方可进行论文答辩；导师和学科组要组织博士生参加有关学术活动，使其了解本学科的发展动向，开阔视野，培养开拓和创新精神博士生在学期间应发表与学位论文相关的学术论文，具体要求参见《南京林业大学关于博士研究生在攻读学位期间发表论文的规定(修订)》（南林研【2011】17 号） 七、综合考试博士生在完成课程学习后进入论文工作之前，必须进行一次综合考试和外语考试，以取得进入学位论文工作的资格综合考试是对博士生基础理论和专业知识在综合性、前沿性和交叉性方向掌握情况的一次综合检查，采用笔试或口试的方式。

笔试应具有一定的深度和广度，大体应覆盖三门以上专业基础和专业课的内容口试可组织由 3～5 名专家组成的考察小组（有基础、专业基础、专业课程教师组成）结合开题报告进行对研究领域的前沿动态、课题实施方案和该博士生应具备的知识结构等进行答辩三分之二专家通过为合格博士生一般应于入学一年后（或学位论文准备开始工作前）进行综合考试综合考试未通过者，允许补考一次，补考仍未通过者，停止做博士论文，终止其学业综合考试的试题、答案，口试记录、评语及成绩交研究生院统一存档八、学位论文博士学位论文应表明作者具有独立从事科学研究工作的能力，应在科学和专门技术上做出创造性的工作，反映作者在本学科上掌握了坚实宽广的基础理论和深入的专门知识博士生入学后，应在导师指导下收集资料，确定研究课题，一般应在第二学期（或第三学期）提出学位论文的开题报告开题报告应由博士生在系学术会议上宣读，并聘请相关学科专业的专家参加，广泛听取意见4论文题目确定后，由博士生在导师指导下拟订具体工作计划，用于论文工作的时间，不能少于整个博士生学习年限的三分之二，以后应按阶段在系学术会议上报告论文工作的进展情况在研究过程中，应完成阶段性研究论文两篇，阶段性论文需在国内外专业学术刊物上发表。

最后的博士生学位论文不是几篇普通论文的简单汇集，而是一篇完整系统的具有创造性成果的合格的博士学位论文要求立题准确、数据翔实、分析严谨、结论正确、格式规范、文字简练；至少在答辩前 2 个月提交论文。