chemdraw-09-Chem3D实例指导.ppt

9.1 利用键工具建立模型,9.2 利用Replacement Text建立模型,9.3 检查结构能量,9.4 ChemDraw和Chem3D信息转换,9.5 分子轨道(HOMO及LUMO),9.1 利用键工具建立模型,Chem3D起始界面,9.1 利用键工具建立模型,Chem3D起始界面,选择,轨迹球,单键,双键,三键,虚键,文本,橡皮,显示设置,,,显示设置属性,,,线状模型,棒状模型,球棍模型,圆柱键模型,比例模型,带状模型,,,,,,,选择【单键】工具，在模型窗口向右按动,圆柱键模型,线状模型,棒状模型,球棍模型,比例模型,带状模型常用于生物分子,选择【轨迹球】工具，使分子模型 在模型窗口沿X、Y轴旋转,X、Y轴旋转指示,,选择【轨迹球】工具并按“Alt”键， 使分子模型在模型窗口沿Z轴旋转,Z轴旋转指示,,模型结构信息,光标位于原子上，自动显示原子信息,,光标位于键上，自动显示键信息,,模型结构信息,模型的进一步信息,模型的键长数据,模型的键长和键角数据,乙烯模型中的双键信息,键级改动,显示氢及孤对电子,不显示氢及孤对电子的环己烷,原子名称及序数,,选择工具，双击原子，按顺序改变原子序号,,利用【键】工具建立的结构，键角及键长可能不正常，应【整理结构】,,环己烷的椅式构象,9.2 利用Replacement Text建立模型,使用【文本】工具输入结构式,,按【Enter】自动转化为模型,括号表示支链,整理结构,简单优化,4-甲基-2-戊醇模型,建立1，2-双甲基环戊烷模型,整理结构,建立Ibuprofen(布洛芬)模型,建立十肽菌素模型,建立十二丙氨酸醇分子模型,改变显示方式,设为线状模型,设为带状模型,a-螺旋模型,使用子结构建立模型,子结构模型库,选择所需的子结构，然后复制,,粘贴复制结果,在子结构上进行编辑,9.3 检查结构能量,,,,模型旋转,对位交叉,总能量计算,空间位阻能：0.977kcal/mol,,计算结果,,,,模型的二面角数据,数据与模型对应,显示原子符号及序号,,,,按动旋转,数据相应改变,对位重叠,空间位阻能：3.906kcal/mol,,计算结果,9.4 ChemDraw和Chem3D信息转换,ChemDraw中 画出的分子结构,复制粘贴到Chem3D中,Chem3D中 画出的分子模型,复制粘贴到 ChemDraw中,9.5 分子轨道(HOMO及LUMO),,显示轨道时必须选择,,选择分子轨道,,选择HOMO轨道,,HOMO轨道显示,乙烯分子的HOMO轨道,,选择LUMO轨道,,LUMO轨道显示,乙烯分子的LUMO轨道,。