代谢组学

1、AB SCIEX高高高高分辨分辨分辨分辨质谱仪在代谢组学中的应质谱仪在代谢组学中的应质谱仪在代谢组学中的应质谱仪在代谢组学中的应用用用用 张克荣张克荣张克荣张克荣 资深技术专家资深技术专家资深技术专家资深技术专家 主要内容主要内容主要内容主要内容 代谢组学研究对高分辨质谱仪的性能要求 TripleTOF高分辨质谱仪在代谢组学研究中的应用 非靶向代谢组学 靶向代谢组学 脂质组学 问题与讨论 2 主要内容主要内容主要内容主要内容 代谢组学研究对高分辨质谱仪的性能要求代谢组学研究对高分辨质谱仪的性能要求代谢组学研究对高分辨质谱仪的。

2、中英联合实验室,代谢组学（metabolomics）,中英联合实验室,测序技术的进步，大规模基因组测序成为可能genomics 表达序列标签EST、微阵列、基因表达连续分析 SAGE，转录组学transcriptomics 生物体系中所有蛋白及其功能的蛋白组学proteomics 研究代谢产物的变化和代谢途径的代谢组学metabolomics,中英联合实验室,中英联合实验室,代谢组学的发展,结构。

3、中英联合实验室,代谢组学（metabolomics）,中英联合实验室,测序技术的进步，大规模基因组测序成为可能genomics 表达序列标签EST、微阵列、基因表达连续分析 SAGE，转录组学transcriptomics 生物体系中所有蛋白及其功能的蛋白组学proteomics 研究代谢产物的变化和代谢途径的代谢组学metabolomics,中英联合实验室,中英联合实验室,代谢组学的发展,结构基因组学：研究生物系统的基因结构组成，即DNA的序列及其表达 。 蛋白组学：研究由生物系统表达的蛋白质及由外部刺激引起的差异 。 代谢组学：研究生物体系（细胞，组织或生物体）受外部刺激。

4、1,2,3,4,口腔生物化学（Oral Biochemistry）一、牙髓、牙周膜、口腔粘膜的代谢 （Metabolism of pulp，periodontal ligament and mucosa ）二、唾液（saliva）三、龈沟液（gingival crevicular fluid）,5,一、牙髓、牙周膜、粘膜的代谢（Metabolism of pulp，periodontal ligament and mucosa ）,代谢：目的是利用外来物质合成自身成分，同时伴随能量利用、转换、贮存。分解代谢（反应）合成代谢（反应）,6,（一）牙髓的代谢（Metabolism of pulp）,1. 牙髓结构特点:（1）疏松结缔组织； （2）封闭，位于硬组织包围的髓腔，仅通过根尖孔与。

5、基因 组学、蛋白质组学、代谢组学简单介绍,汇报人：王静 园研2011果树学,目录,基因组学,蛋白质组学,代谢组学,1.基因组学,基本概念,研究历史,前遗传学时代1900年以前,经典遗传学时代1900-1950年,分子生物学时代1950-1990年,基因组学时代1990-2000年,后基因组学时代2001年以后,1859年，达尔文自然选择学说 1865年，孟德尔分离规律、独立分配原则,1900年，孟德尔遗传规律再被发现标志着遗传学的诞生,Waston&CrickDNA双螺旋模型的发现,人类基因组计划,功能基因组学、蛋白质组学的兴起,研究意义,基因组学的研究已经涉及到生物学、医学、制药工。

6、基因 组学、蛋白质组学、代谢组学简单 介绍汇报人：王静园研2011果树学目录1基因组学2蛋白质组学3代谢组学1.基因组学基本概念研究历史前遗传 学时代 1900年 以前经典遗 传学时 代1900- 1950年分子生 物学时 代1950- 1990年基因组 学时代 1990- 2000年后基因 组学时 代2001 年以后1859年，达 尔文自然 选择 学说 1865年，孟 德尔分离 规律、独 立分配原 则1900年，孟 德尔遗传 规律再被发 现标志着遗 传学的诞生Waston& Crick DNA双螺 旋模型的 发现人类基因组 计划功能基因组 学、蛋白质 组学的兴起研究意义基因组学的研究已经涉及到生物。

7、医学代谢组学香山科学会议综述 代谢组学metabolomics 或 metabonomics是继 基因组学、转录组学和蛋白质组学之后在学术界兴起的又一门新的系统生物学分支 它是通过考察生物体系受刺激或扰动前后如将某个特定的基因变异或环境变化后代 谢产物图谱及其动态变化来研究生物体系的代谢网络的一种技术研究对象主要是针 对分子量1000以下的内源性小分子。与转录组学和蛋白质组学等其他组学比较代谢 组学具有以下优点 基因和蛋白表达的微小变化会在代谢物水平得到放大 代谢组学 的研究不需进行全基因组测序或建立大量表达序列标签EST的数据库代谢物。

8、植物代谢组学及其应用 河南农业大学生命科学学院赵会杰 目录 一 植物代谢组学的概念和意义二 代谢组学在系统生物学中的地位三 植物代谢组学的研究方法四 代谢组学在植物科学中的应用五 展望 一 植物代谢组学的概念和意义 1 概念 生物学中 组 的概念 组 来源于希腊语ome 意指每个 所有 全部 以它为后缀最先用于基因组 genome 指一个物种的全部遗传组成 自基因组学概念提出后 带组学 omics。

9、1 名词解释 1. 系统生物学系统生物学是系统性地研究一个生物系统中所有组成成分（DNA、RNA、蛋白质、代谢物等）的构成以及在特定条件下这些组分间的相互关系，并分析生物系统在一定时间内的动力学过程。 2. 生。

10、江南大学,1,代谢组学-方法与应用 授课教师 ：吴敬 教授 授课时间：2009年11月,江南大学,2,“基因组学反映了什么是可以发生的，转录组学反映的是将要发生的，蛋白质组学指出了赖以发生的，只有代谢组学才真正反映业已发生的。” 许国旺,江南大学,3,第一章 代谢组学的简介 第二章 代谢组学的研究方法 第四章 代谢组学的应用 第五章 代谢组学的发展前景,江南大学,4,组学时代4种最重要的组学,江南大学,5,代谢组学（Metabonomics/ Metabolomics ）是通过考察生物体系（细胞、组织 或生物体）受刺激或扰动后（如将某个特定的基因变异或环境变化。

11、中英联合实验室,代谢组学（metabolomics）,中英联合实验室,测序技术的进步，大规模基因组测序成为可能genomics 表达序列标签EST、微阵列、基因表达连续分析 SAGE，转录组学transcriptomics 生物体系中所有蛋白及其功能的蛋白组学proteomics 研究代谢产物的变化和代谢途径的代谢组学metabolomics,中英联合实验室,中英联合实验室,代谢组学的发展,结构。

12、植物代谢组学及其应用,河南农业大学生命科学学院 赵会杰,目 录,一、植物代谢组学的概念和意义 二、代谢组学在系统生物学中的地位 三、植物代谢组学的研究方法 四、代谢组学在植物科学中的应用 五、展望,一、植物代谢组学的概念和意义,1、概念,生物学中“组”的概念： “组”：来源于希腊语ome，意指每个、所有、全部。 以它为后缀最先用于基因组：genome,指一个物种的全部遗传组成。 自基因组学概念提出后，带组学（omics)的概念出现有200多种。如蛋白组学、代谢组学等。,近年来,随着生命科学研究的发展,尤其是完成拟南芥(Arabidopsis tha。

13、代谢组学小常识概念： 代谢组：指一个细胞、组织或器官中所有代谢物的集合, 包含一系列不同类型的小分子（通常分子量1000）, 比如肽、碳水化合物、脂类、核酸等。 代谢组学：通过考察生物体系（细胞、组织或生物体）受刺激或扰动后，其代谢产物的变化或其随时间的变化，来研究生物体系的一门科学。实验流程：（以液质联用为基础的代谢组学为例） 样本前处理：在保证小分子代谢物完整的前提下，处理的步骤越简单越好，以保证操作容易重复，也为大批量样本的处理节约时间。 数据采集：依据实验目的有所不同。o 非目标代谢组学：选用高分辨质。

14、代谢组学小常识概念： 代谢组：指一个细胞、组织或器官中所有代谢物的集合, 包含一系列不同类型的小分子（通常分子量1000）, 比如肽、碳水化合物、脂类、核酸等。 代谢组学：通过考察生物体系（细胞、组织或生物体）受刺激或扰动后，其代谢产物的变化或其随时间的变化，来研究生物体系的一门科学。实验流程：（以液质联用为基础的代谢组学为例） 样本前处理：在保证小分子代谢物完整的前提下，处理的步骤越简单越好，以保证操作容易重复，也为大批量样本的处理节约时间。 数据采集：依据实验目的有所不同。o 非目标代谢组学：选用高分辨质。

15、All screen shots taken from v. 1.22.01. Page 1 Last Update: 30 AUG 2012 XCMS Online Usage Instructions Overview XCMS Online is an innovative platform with an intuitive graphical interface which allows users to easily upload and process LC/MS data for untargeted metabolomics profiling. XCMS Online provides a complete metabolomics workflow including feature detection, retention time correction, alignment, annotation and statistical analysis. To facilitate the usage, predefined parameter sets for。

16、代谢组学小常识概念： 代谢组：指一个细胞、组织或器官中所有代谢物的集合, 包含一系列不同类型的小分子（通常分子量1000）, 比如肽、碳水化合物、脂类、核酸等。 代谢组学：通过考察生物体系（细胞、组织或生物体）受刺激或扰动后，其代谢产物的变化或其随时间的变化，来研究生物体系的一门科学。实验流程：（以液质联用为基础的代谢组学为例） 样本前处理：在保证小分子代谢物完整的前提下，处理的步骤越简单越好，以保证操作容易重复，也为大批量样本的处理节约时间。 数据采集：依据实验目的有所不同。o 非目标代谢组学：选用高分辨质。

17、江南大学,1,代谢组学-方法与应用 授课教师 ：吴敬 教授 授课时间：2009年11月,2,“基因组学反映了什么是可以发生的，转录组学反映的是将要发生的，蛋白质组学指出了赖以发生的，只有代谢组学才真正反映业已发生的。” 许国旺,江南大学,3,第一章 代谢组学的简介 第二章 代谢组学的研究方法 第四章 代谢组学的应用 第五章 代谢组学的发展前景,江南大学,4,组学时代4种最重要的组学,江南大学,5,代谢组学（Metabonomics/ Metabolomics ）是通过考察生物体系（细胞、组织 或生物体）受刺激或扰动后（如将某个特定的基因变异或环境变化后），其代。

18、代谢组学：基于质谱的研究方法,汇报人：张富昌 指导教师：田中民 西安交通大学 2014年4月13日,内容提要,一、代谢组学基本知识 二、 GC-MS和LC-MS 三、发现代谢组学,一、代谢组学基本知识,1、什么是代谢组学,代谢组学是通过比较对照组和实验组的代谢组（metabolomes，某一生物的所有代谢物组分），以寻找其它代谢谱差异的研究方法。这些差异可能与临床生物标志物发现中研究的某些疾病相关，也可能与药物研发毒理研究中候选药物摄入后的代谢改变有关。,一、代谢组学基本知识,2、代谢组学的一般流程,发现代谢组学,靶向代谢组学,代谢组学,一、。

19、Introduction of metabonomics/metabolomics,2009-06-26,The flow of the “omics” sciences: genomics, proteomics, and metabolomics,Spratlin J.L. , et al. Clin Cancer Res, 2009 January 15, 15(2):431-440,Wh。

20、江南大学,1,代谢组学-方法与应用 授课教师 ：吴敬 教授 授课时间：2009年11月,江南大学,2,“基因组学反映了什么是可以发生的，转录组学反映的是将要发生的，蛋白质组学指出了赖以发生的，只有代谢组学才真正反映业已发生的。” 许国旺,江南大学,3,第一章 代谢组学的简介 第二章 代谢组学的研究方法 第四章 代谢组学的应用 第五章 代谢组学的发展前景,江南大学,4,组学时代4种最重要的组学,江南大学,5,代谢组学（Metabonomics/ Metabolomics ）是通过考察生物体系（细胞、组织 或生物体）受刺激或扰动后（如将某个特定的基因变异或环境变化。