薛立-发展研究(修改)
13页1、基因检测的应用现状及发展研究1 概述1.1 相关概念基因:是遗传的物质基础,是DNA(脱氧核糖核酸)分子上具有遗传信息的特定核苷酸序列的总称,是具有遗传效应的DNA分子片段。基因检测:指通过基因芯片等方法对被测者细胞中的DNA分子进行检测,并分析被检测者所含致病基因、疾病易感性基因等情况的一种技术。1.2 基因检测的应用基因检测的主要应用在无创产前检测,基因体检以及基于基因体检的个体用药方面。无创产前检测是采取母体外周血,利用第二代测序技术血样中的中的游离DNA片段(包含胎儿游离DNA)进行测序,通过生物学信息分析,从而检测胎儿是否患21三体综合征(唐氏综合征)、18三体综合征(爱德华氏综合征)、13三体综合征(帕陶氏综合征)三大染色体疾病。基因体检目前主要是利用SNP芯片等测序技术进行检测,然后对比数据库进行易感基因分析,然后进行相关分析出具报告。基因是人在没发病时,预测将来会发生什么疾病,即是主动预防疾病的发生。基因体检主要目的有四个:一是用于疾病的诊断;例如白血病的诊断分类等,都需要进行相关的基因检测;二是疾病的预防,就是检测健康人群的基因型,预测个人患病的风险,并向受检者提出生
2、活上的指导,避免疾病的发生。基因体检可以对疾病做到:早知道、早预防、早调整、早治疗;三是了解自己的基因特征,指通过检查基因来发现现有的和潜在的个人特性;四是个性化用药基因检测,对疾病发展进程极快的癌症等疾病,以及需长期服药的“三高”人群,筛选适应个体的高效、特效药和最佳诊疗方案,提供科学的用药、治疗依据。2 基因检测的应用环境2.1上游技术促进基因检测应用目前基因检测技术主要归功于NGS的进步,上游产业技术已经成熟。 NGS自2005年454公司首先推出了二代测序仪;2006年,Solexa推出了Genome Analyzer,2007年Illumina收购Solexa公司,在随后的几年陆续推出了Hiseq2000、MiSeq、Hiseq2500、MiseqDx、NextSeq 500测序仪,成为主流的测序平台。ABI也在2007年推出的是SOLiD测序平台,随后收购了454测序仪发明者创立的Ion Torrent,转而大力推广PGM和Ion Proton平台。 Oxford Nanopore MinION测序仪只有USB存储器那么大等等至今是NGS第十年,illumina公司的His
3、eq X平台已经实现了1000美金一个人类基因组测序的目标。相比十年前的30亿美金降低了300万倍。除此以外,还有好多公司开发了第三代测序仪,比如Pacific Biosciences的PacBio RS测序仪,DNA模板无需二代测序常用的PCR扩增的方法,就可以实现长读长、实时的测序;Oxford Nanopore MinION测序仪只有USB存储器那么大等。技术上的进步不仅提高了检测的精度,并降低科研成本,也为下游的基因检测创造了发展的契机。基因检测本身很容易,难的是分析和对比,而这一切都需要有强大的数据和技术支持。随着千万的科研工作者的努力和上游测序技术的进步。极力的促进大数据的的几何量增长,完善。自2000年人类基因体计划完成以来,越来越多的基因功能被解读成功,已超过2000种基因相关疾病被发现,如今已有700多种基因相关疾病已开发出相应药物及治疗方法,研究的领域也在不断扩大,现在研究的热点已经已经从外显子,micRNA,甲基化扩展到GWAS,LncRNA领域。2.2.1国外的应用及发展现状在美国和欧洲,主要应用于产前诊断如下:1999年,美国有350个从事致病基因检测的实验室
4、,而到了2006年,这一数字增长为1400个;美国食品药品管理局(FDA)已经批准认可了110个与癌症诊断和医疗相关的生物标记位点。医生可以直接根据这些突变位点制定医疗方法进行治美国在10年前开始将致病基因检测技术应用于临床,并于5年前正式开始临床收费。美国有超过800万人接受了基因检测。占美国总人口的1/25,已有多个基因检测项目被纳入国家医保范围。最近已经相继把乳腺癌的5年内风险检测和肺癌分子诊断(2015年1月1日实施)纳入医保范围。近日,英国投资3亿英镑欲改变疾病的诊断和治疗方式,该项目将历时四年,科学家将开展创新研究来解码10万个人类基因组,如病患个人DNA密码。该项目一旦成功实施会使得英国成为癌症和罕见病遗传研究的全球领先者。2.2.2国内的应用及发展现状与美国如火如荼的基因检测行业相比,基因检测产业在我国发展较慢。基因检测项目需要临床资质。而我国70%的基因检测公司没有相应的临床资质,进行基因检测必须通过临床医生,这必然制约基因检测项目的开展。而且由于缺乏监管,临床医生不知道或忽略了对患者进行基因检测,很大程度上限制了该产业的发展。缺乏标准也是重要原因。目前我国没有基因检
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