全新药物设计软件-muse 发布会邀请函
4页1、Tripos/源资第四届分子模拟和药物设计软件源资第四届分子模拟和药物设计软件 SYBYL 培训班培训班 全新药物设计软件全新药物设计软件-MUSE 发布会邀请函发布会邀请函 培训主题:药效团模建及数据库搜索和管理培训主题:药效团模建及数据库搜索和管理 MUSE-2009 年年 3 月月 5 日,正式发布!日,正式发布! Tripos 公司新平台 Pantheon 下的第一个产品。 “Pantheon”在希腊语中, 意思是“万神殿”, 是供奉宇宙主要神祗的宫殿。在万神殿中,你会见到神奇的远古众神,传说受到众神祝福的 人,将会得到无限的智慧和力量,被授予永远的财富。Tripos 公司即将推出 CADD 领域的 “Pantheon”,它集多年的科研实力与最新技术于一体,在药物设计和分子模拟领域打造一 个全新的“万神殿”。在“Pantheon”平台上,会陆续引入各种药物设计方法,2009 年 1 月,“万 神殿”里第一位向我们走来是 MUSE(缪斯)女神,她通常是一篇史诗或故事开启的象征。 MUSE 是为加快先导候选药物识别与优化而设计的一个成熟的全新药物设计工作流程。 利用 MUSE,CA
2、DD 科研工作者以及药物化学工作者可以进行满足特定设计指标的全新结 构、骨架、或侧链的识别。适用于先导化合物的替换、骨架替换或在固定母核周围产生新的 R-基团,生成满足多重设计指标的新颖类药化合物。采用此产品,必将会在重大新药创制中 助您一臂之力!详细内容敬请关注我们的新品发布会。 SYBYL Tripos 公司(The New Tripos International)的旗舰产品 SYBYL 一直是全球制药及化学 工业所依赖的最先进的分子模拟和计算机辅助药物研发工具,持续的产品更新及功能增强, 使产品功能适用于整个药物研发阶段, 并逐渐渗入到生命科学, 环境科学, 化学化工等领域。 继Tripos/源资分子模拟和药物设计软件SYBYL2008 年成功举办三届培训班后(详情请 参见http:/www.tri- , 应广大学员及相关领域专家的呼吁, Tripos/源资将在南 京举办第四届培训班。如果您也有这方面需求,欢迎与我们合办后期的培训。 1 培训内容培训内容 本届培训将集中讲授 SYBYL 中药效团建模及数据库搜索和管理, 它们是计算机辅助药 物设计领域中非常实用的方法。综合使用这
3、些方法,可以进行快速准确的虚拟筛选、生物活 性预测、化学结构信息检索等工作。本次培训涉及的模块包括: ? SYBYL 基础模块基础模块:SYBYL Base,MSS,Concord Sketch ? 药效团建模药效团建模:GALAHAD 与 GASP ? 数据库与化学信息管理数据库与化学信息管理:UNITY Base 与 UNITY 3D ? 全新药物设计全新药物设计:MUSE 在 SYBYL 中提供了多种的药效团识别方式:GASP,GALAHAD。其中 GASP 识别的 是公共药效团。 根据经典的药效团理论, 结合于同一受体的分子其活性具有差别是因为它们 与受体的相互作用药效特征数量不一样导致,在 GALAHAD 中就可以允许出现部分匹配。 药效团建模与数据库搜索是分不开的,SYBYL 平台中 UNITY 与药效团建模方法紧密结合, 能完成基于药效团模型的虚拟筛选及精细的后处理工作。 UNITY 作为化学数据库搜索、分析、管理系统,能完成从简单到复杂的数据库搜索, 包括二维子结构搜索、三维数据库搜索、相似性搜索、基于药效团的搜索等。三维数据库搜 索方法有效地加速先导物的发现,柔性构象
4、的三维搜索可以快速发现满足提问结构的分子。 这些提问结构可以是基于分子、分子片段、药效团模型或受体位点。 此次培训,将从原理到应用讲解以上模块,并提供高性能电脑供学员上机实习;现场会 有专业技术人员为您的课题提供技术解答。 考虑到学员对SYBYL软件的熟悉程度有所差异, 培训期间,首日将进行 SYBYL 与 Linux 系统基础训练,以帮助初次接触 SYBYL 的学员尽 快入门;培训的后两天将讲授并实习进阶内容。本次培训提供两种学习方案: A. 参加全部三天培训,适合初次接触 SYBYL 的用户 B. 参加后两天培训,适合有一定 SYBYL 使用经验的用户 课程目标课程目标 SYBYL 基础模块:SYBYL Base,MSS,Concord Sketch ? 鼠标与图形窗口操作 ? 分子表面渲染及性质计算(MOLCAD) ? 分子表格数据输入与导出,各种数据存储格式的转化(MSS) 药效团建模:GALAHAD 与 GASP ? 给定一个数据集,产生并检查药效团模型 ? 识别得分优势的模型 ? 将化合物叠合到药效团模型上,并检视叠合结果 ? 修饰药效团建模产生的药效团模型的药效特征及其约
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