医学ppt课件大全肿瘤诊断和预后生物标志物的研究进展
59页1、肿瘤诊断和预后生物标志物的研究进展,曹志成 院士,2010年5月22日,香港伊利沙伯医院,结论 五个基因指纹与非小细胞肺癌的无复发生存期和总生存期密切相关,Dual-specificity phosphatase 6 (DUSP6), monocyte-to-macrophage differentiation associated protein (MMD), signal transducer and activator of transcription 1 (STAT1), v-erb-b2 avian erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 3 (ERBB3), lymphocyte-specific protein tyrosine kinase (LCK).,根据五个基因指纹RT-PCR检测的不同结果,用Kaplan-Meier法分析非小细胞肺癌患者的生存时间 Overall survival and relapse-free survival are shown for the 101 patients with NS
2、CLC (Panel A and Panel B, respectively) and for the 59 patients with stage I or II disease (Panel C and Panel D, respectively). Overall survival is also shown for the independent cohort of 60 patients (Panel E), for the 42 patients in this cohort who had stage I or II disease (Panel F), and for the 86 patients described in an independent set of published NSCLC microarray data10 (Panel G).,设定为 10%假阴性 灵敏性 91 %, 特异性 73%,70 个预后相关基因表达谱 监督分析,70 个预后相关基因 与肿瘤细胞生物学各个方面均有关,微阵列试验具有高度的可重复性 (99%),Glas et al,
3、BMC Genomics 2007,可重复性:重复试验,良好预后组患者没有一例复发,MammaPrint:良好预后组(n = 23)不良预后组(n = 144),Straver M et al, Brit Cancer Res Treat 2009,Oncotype Dx的临床研究发展,发展高通量、实时RT-PCR技术来定量检测固定肿瘤标本中的基因表达筛选出250个候选基因 在来自3个临床研究、共447例患者中检测250个候选基因与复发风险的相关性,16 个肿瘤相关基因 + 5 个参考基因 Oncotype DX (复发风险指数),Paik et al. NEJM. 2004.,如何评估乳腺癌患者的复发风险,传统病理学标准,细胞增殖 Ki-67 STK15 Survivin Cyclin B1 MYBL2,雌激素 ER PR Bcl2 SCUBE2,细胞侵润 Stromelysin 3 Cathepsin L2,HER2 GRB7 HER2,BAG1,GSTM1,参考基因 Beta-actin GAPDH RPLPO GUS TFRC,CD68,Paik et al, NEJM 200
4、4;351:2817-26,16个肿瘤基因和5个参考基因构成了Oncotype DX基因组,根据这些基因的表达情况计算复发指数:,Oncotype DX 21-基因复发指数,复发指数,低危组 RS 18 复发风险 = 6.8% C.I. = 4.0% - 9.6%,中危组 RS 18 - 31 复发风险 = 14.3% C.I. = 8.3% - 20.3%,高危组 RS 31 复发风险 = 30.5% C.I. = 23.6% - 37.4%,Paik et al, NEJM 2004;351:2817-26,Oncotype DX,低复发指数(RS)与最小化疗获益相关;高复发指数(RS)与较好的化疗获益相关。Oncotype DX复发指数提供了简洁、定量的个体预后信息,是具有统计学意义、与患者年龄、肿瘤大小和肿瘤分期分级无关的独立指标。,2006年诺贝尔生理学和医学奖,Andrew Z. Fire Craig C. Mello,C. elegans,Cho WC. MicroRNAs in cancer - from research to therapy. Biochim Bio
5、phys Acta - Rev Cancer 2010;1805:209-17,非编码-RNA:曾经被认为是毫无意义的多余物,tRNA rRNA snRNA tmRNA Rnase P RNA vRNAs gRNAs MRP RNA SRP RNAs 端粒酶RNA,转录/染色体结构调节因子 转录调节因子 蛋白功能调节因子 RNA/蛋白定位调节因子,RNA 转录,调节RNA miRNA siRNA piRNA 反义 RNA,编码蛋白的mRNA,非编码 RNA 转录,核仁小RNAs,管家 RNAs,非编码-RNA在复杂的基因组学中起重要作用,肺癌诊断和预后的独特microRNA表达谱,先天和后天的转变可能改变miRNA的表达,从而引起肿瘤靶基因的异常表达,Yanaihara et al, Cancer Cell 2006:- 采用miRNA微阵列法对104对原发性肺癌和相应非肿瘤肺部组织的miRNA表达谱做分析- 43个miRNAs显示出了统计学差异,miRNAs是非编码的小RNA,在调节mRNA的反应和降解中发挥重要作用,一项单变量Cox比例风险回归模型全局排列检验显示:miRNA hs
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