鲤鱼克隆及二级结构的预测与分析
9页1、n 更多资料请访问.(.)更多企业学院:./Shop/中小企业管理全能版183套讲座+89700份资料./Shop/40.shtml总经理、高层管理49套讲座+16388份资料./Shop/38.shtml中层管理学院46套讲座+6020份资料./Shop/39.shtml国学智慧、易经46套讲座./Shop/41.shtml人力资源学院56套讲座+27123份资料./Shop/44.shtml各阶段员工培训学院77套讲座+ 324份资料./Shop/49.shtml员工管理企业学院67套讲座+ 8720份资料./Shop/42.shtml工厂生产管理学院52套讲座+ 13920份资料./Shop/43.shtml财务管理学院53套讲座+ 17945份资料./Shop/45.shtml销售经理学院56套讲座+ 14350份资料./Shop/46.shtml销售人员培训学院72套讲座+ 4879份资料./Shop/47.shtml黑龙江野鲤核糖体内转录间隔区(ITS-1)的克隆及二级结构的预测与分析基金项目:农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室开放基金项目(BZ2009-05
2、);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项基金(中国水产科学研究院淡水渔业研究中心)(2007JBFB04)作者简介:钟立强(1985 - ), 男 , 江苏高邮人 , 硕士 , 主要从事水产动物遗传育种研究。(Email)stevezhong1985163. 通讯作者:朱健, (Email)zhujffrc. 钟立强1,2,张成锋2,蔡生力1,刘红1,李冰2,3,朱健1,2,3(1. 上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306; 2.农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室,中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,江苏 无锡 214081;3.南京农业大学无锡渔业学院,江苏 无锡 214081)摘要: 【目的】黑龙江野鲤是我国北方重要的养殖鱼类,分析和了解其遗传结构对鲤鱼种质资源的保护和遗传性状的改良具有重要的意义。【方法】对黑龙江野鲤(Cyprinus carpio haematopterus)核糖体内转录间隔区 (ITS-1)进行了克隆测序,并对 ITS-1序列进行了分析。【结果】结果显示,所克隆的黑龙江野鲤ITS-1序列长度为365 bp,其中 A、T、G、C 4种碱基
3、的含量分别为21.4%、12.3%、34.0% 和32.3%;与从GenBank中检索到的6种鲤科鱼类的ITS-1序列相比较,相似性较低,介于24.9% 59.5%之间;同时利用最小自由能原理预测了7种鲤科鱼类ITS-1序列的二级结构,并分析了其结构特点。【结论】根据鲤鱼与其他6种鲤科鱼类的ITS-1序列的同源性构建NJ系统进化树,所得的分类结果与传统的分类结果基本一致。在ITS-1序列的二级结构中,微卫星序列主要分布于环和凸起部位,并导致了核苷酸变异和序列长度差异。一、二级结构相结合将是研究物种分子系统学的重要手段关键词:黑龙江野鲤 (Cyprinus carpio haematopterus);内转录间隔区 1(ITS-1); 基因克隆; 二级结构Cloning and secondary structure analysis of the rDNA internal transcribed spacer 1 in Cyprinus carpio haematopterusZHONG Li-qiang 1,2,ZHANG Cheng-feng 2,Cai Sheng-li 1,Li
4、u Hong 1,LI Bing 2,3, ZHU Jian1,2,3(1. Fisheries and Aqua-life science College, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China; 2. Key laboratory of Genetic Breeding and Aquaculture Biology of Freshwater Fishes, Ministry of Agriculture, Freshwater Fisheries Research Center, Chinese Academy of Fishery Science, Wuxi 214081, China; 3. Fisheries College, Nanjing Agriculture University, Wuxi 214081, China)Abstract: Cyprinus carpio haematopterus was an important freshwater fish in North China. Anal
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