分析报告:雌激素受体α (ERα)
雌激素受体 (ER) (梁庄严、卢远彬、苏国明、张雪梅)组分析报告目录雌激素受体 (ER)功能概述 .3第一问:目标蛋白序列 .3第二问、蛋白质基序分析、活性位点、结构分析、功能分析 .3一、结构与功能分析 .31、核激素受体锌指结构域 .32、核激素受体配基结合域 .33、核激素受体配基结合域的核心区域 .34、雌激素核受体 C 末端区域 .4二、基序分析 .5三、活性口袋分析 .5第三问:多序列比对 .51、选择以下七个物种 .52、比对结果 .6第四问:晶体结构图 .91、2Q6J,Crystal Structure of Estrogen Receptor alpha Complexed to a B-N Substituted Ligand .92、3DT3,Human Estrogen receptor alpha LBD with GW368 .93、2OCF ,Human estrogen receptor alpha ligand-binding domain in complex .104、2Q6J 与 3DT3 两分子晶体结构重叠图。 .105、2Q6J、3DT3、2OCF 三分子晶体结构重叠图。 .11第五问:系统进化树 .121、phylip 生成的进化树文件 outtree.tre,用 treeview 打开的结果。 .122、phylip 生成的进化树文件 outtree.tre,用 bioedit 打开的结果。 .123、ClustalX 生成的 dnd 文件 treeview 打开。 .134、ClustalX 生成的 dnd 文件 bioedit 打开。 .13附:蛋白质二级结构预测。 .14一、Sopma 上的预测结果 .14二、Jpred 上搜索到的 PDB 结构图 .14雌激素受体 (ER)功能概述This gene encodes an estrogen receptor, a ligand-activated transcription factor composed of several domains important for hormone binding, DNA binding, and activation of transcription. The protein localizes to the nucleus where it may form a homodimer or a heterodimer with estrogen receptor 2. Estrogen and its receptors are essential for sexual development and reproductive function, but also play a role in other tissues such as bone. Estrogen receptors are also involved in pathological processes including breast cancer, endometrial cancer, and osteoporosis. Alternative splicing results in several transcript variants, which differ in their 5' UTRs and use different promoters.第一问:目标蛋白序列>gi|5442