2015pubmed检索攻略.ppt

PubMed,天津医科大学图书馆 孙向丽,一、PubMed概述,二、PubMed检索途径与使用方法,主要内容,三、 循证医学文献检索,一、PubMed概述,PubMed是由美国国立医学图书馆(National Library of Medicine , NLM)下属美国生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information ,NCBI)研制的基于Web的文献数据库 收录全世界包括美国在内80多个国家的5000余种生物医学期刊的文摘及题录数据，内容涉及护理学、牙科学、兽医学、药理学、保健系统等医学各个领域 现有文献2200万余条，收录文献时间起自20世纪50年代,简介,PubMed提供部分免费全文，包括① NLM开发的免费生物医学数字化期刊全文数据库PubMed Central(PMC)； ②开放获取(Open Access, OA)期刊的文献； ③部分出版商提供的免费期刊文献 PubMed每条记录均有惟一的识别号PMID(PubMed Unique Identifier) MEDLINE: PubMed主体部分，记录均标有[PubMed-indexed for MEDLINE] In Process Citation: 又称PreMEDLINE,记录均标有[PubMed-in process] Publisher-Supplied Citation:记录均标有[PubMed-as supplied by publisher],,,,,[PubMed-indexed for MEDLINE],[PubMed-as supplied by publisher],[PubMed-in process],NLM早在1879年即开始编译医学文献的检索刊物《医学索引》(Index Medicus ,IM) 从1964年起，采用计算机进行电子编辑和排版，在此基础上开发了“医学文献分析与检索系统”(Medical Literature Analysis & Retrieval System)，即著名的MEDLARS系统 1971年正式建立了该系统的联机系统，称为“MEDLARS联机检索系统”(MEDLARS online)，即MEDLINE系统 随着网络技术的发展，开发人员致力于将MEDLINE数据库的信息放到网上，供广大医务人员免费使用。

从1997年6月起，PubMed开始在网上免费向读者提供服务,发展历程,收录范围广、内容齐全、回溯时间长 免费提供题录、文摘 检索功能完善、使用方便 提供检索词自动转换匹配功能、MeSH主题词检索 提供相关文献链接:Related citations, Linkout 更新速度快:数据实时更新 个性化服务(My NCBI),特点,,PubMed提供检索词自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping ,ATM) PubMed对键入的检索词自动进行分析、匹配、转换并检索，是一种智能化的检索过程 MeSH转换表 Vitamin h→ “biotin“[MeSH Terms] OR “biotin“[All Fields] OR “vitamin h“[All Fields] 期刊转换表 new england journal of medicine → “N Engl J Med“[Journal] OR “new england journal of medicine“[All Fields] 作者索引 Smith JA → Smith JA[Author],,基 本 检 索 高 级 检 索 主 题 词 检 索 题 录 检 索 期 刊 检 索,二、PubMed检索途径与使用方法,,点击数据库名称,,,,,,,基本检索框,高级检索,题录检索,主题词检索,期刊检索,,,临床查询,临床试验,,输入检索式,例：检索有关心瓣膜疾病（heart valve disease）诊断（diagnosis）方面的文献。

点击“Search”,,检索结果,,,显示设置,,标题含有检索词文献,,,,,,查找相关文献,详细检索过程,点击“See more”,免费全文,,点击“URL”,,,,点击“Save search”,,点击注册帐户,,,,点击注册,,点击登录,输入用户名和密码,,,,,点击“Save”,,显示用户名,,,点击“Save”,,点击篇名,,,,点击出版物类型,,相关文献,,点击“LinkOut”,,,点击数据库名称,,,,时间限定,,,文献类型限定,,,语种限定,,限定结果,,,,点击高级检索,,,,,检索式显示框,构建检索式,检索历史,,输入检索词,,,显示索引,,,例：检索2009年以来发表的有关肿瘤护理方面的英文综述性文献,输入检索词,选择检索字段,点击“Search”,,,完整检索式,,,,,检索结果,,点击主题词检索,,输入检索词,,点击“Search”,,例：通过主题词途径，检索有关心肌梗塞（myocardial infarction）方面的文献,,,添加到检索框检索,,勾选 主题词,,,检索结果,输入检索词,,,点击“Search”,例：通过主题词途径，检索有关心肌梗塞（myocardial infarction）预防（prevention and control)方面的文献,,确定主题词,,,,选择副主题词,添加到检索框检索,主题词加权 检索选项,,检索结果,,例：通过主题词途径，检索有关心肌梗塞（myocardial infarction）预防（prevention and control)方面的文献。

要求主题词加权、不扩展检索,,,勾选加权检索、不扩展检索选项,添加到检索框检索,,,检索结果,,,题录检索,,,例：检索《病毒杂志》（archives of virology）2009年发表的《基因稳定性与连续性分析》（genetic stability and linkage analysis）这篇文献,,,,输入检索信息,点击“Search”,,,点击期刊检索,,检索框,,,,输入刊名,点击“Search”,例：查找《新英格兰医学杂志》（nejm）,PubMed基本检索规则,布尔运算符AND，OR，NOT必须大写 例如：vitamin OR zinc PubMed从左至右进行布尔运算，可以通过加圆括符改变运算顺序 例如：common cold AND (vitamin OR zinc),指定文献记录字段名称检索 例如：DNA［mh］ AND crick［au］ AND 1993［dp］ 常用字段名称缩写： DP——出版日期 如1998［dp］；输入日期范围则用冒号连接，如1996：1998［dp］ AD——第一作者机构名称、地址、资助号 如tianjin［ad］ AU——作者姓名 如woods［au］ TA——期刊名称 包括期刊名全称、简称、ISSN 如science［ta］或0021-9258［ta］ LA——文献出版语言 如Chinese［la］ MH—— Mesh主题词 如neoplasm［mh］ PT——出版类型 如review［pt］ TW——自由词 TI——文献标题内自由词 如leiomyosarcoma［ti］,作者姓名[字段标识] Woods[au],,,,,,输入检索词,,详细检索过程,,输入检索词,,,详细检索过程,刊名[字段标识] Science[ta],,,,输入检索词,,详细检索过程,,输入检索词,,详细检索过程,词组检索 例如：“single cell” 截词检索：* 例如：输入infect*，可检出infection，infectious，infective，infectivity，infector等 截词检索只限于单词，对词组无效,双引号，系统进行强制检索 注意：检索词自动转换匹配功能关闭,,输入检索词,,检索结果,,详细检索过程,词组检索,,输入检索词,检索结果,,,详细检索过程,*通配符，可同时检索含有infection，infected，infections等词的文献 注意：检索词自动转换匹配功能关闭,,输入检索词,,,,,详细检索过程,禁用词表,临床查询（Clinical Queries） Clinical Study Categories（临床研究类文献） Systematic Reviews（系统评价） Medical Genetics（医学遗传学） MeSH: Clinical Queries 结果限定选项 直接以systematic review、Cochrane、meta-analysis、Randomized Controlled Trial等为关键词进行检索 Clinical Trials （http://clinicaltrials.gov/）,三、循证医学文献检索,,,点击临床查询,,例:临床医生想检索胆囊炎(cholecystitis)诊断方面的文献，要求检索结果比较准确,专用于检索疾病的etiology、diagnosis、therapy、prognosis(预后)、clinical predictions guides(临床预报指南)等方面文献,专用于检索Systematic Reviews、meta analysis、reviews of clinical trials(临床试验综述)、guidelines(临床指南)等循证医学文献,专用于检索疾病遗传学方面的文献。

All、diagnosis、differential diagnosis(鉴别诊断)、clinical description(临床描述)、 management(处理)、genetics counseling(遗传咨询)、molecular genetics(分子遗传学)、genetics tesat(遗传测试)等方面文献,,,,,,输入检索词,点击“Search”,,,,,,,Clinical Study Categories（临床研究类文献）,,点击“see all”,,,,Systematic Reviews（系统评价） Medical Genetics （医学遗传学）,,点击“see all”,,点击“see all”,,,,点击“Search”,输入检索词,,,点击主题词,,,点击临床查询,,,,,输入检索式,,点击“Search”,,,点击“more”,选择文献类型,,,同时输入检索词 systematic review,,,点击“Search”,,,,检索结果,,,点击临床试验,,美国国立医学图书馆研制开发的临床试验数据库收录了美国及世界170多个国家经注册登记的8万多条临床试验的详细信息，是十分重要的循证医学信息资源。